.Kinetic coupling: Structure and dynamics of biochemical networks linked through new concept

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.Kinetic coupling: Structure and dynamics of biochemical networks linked through new concept

동역학적 결합: 새로운 개념을 통해 연결된 생화학적 네트워크의 구조와 역학

동역학적인 연결 - 생화학적 이해가 어려워질 수 있습니다.

포츠담 대학교 Gaby Clark 가 편집하고 Robert Egan 이 검토했습니다. 편집자 주 생화학 네트워크와 다양한 동역학 모듈(색상)을 나타낸 그림입니다. 화살표는 한 대사산물(점)의 조합을 다른 조합으로 변환하는 반응을 나타냅니다. 선이 굵을수록 각 반응의 흐름이 더 활발함을 의미합니다. 출처: 조란 니콜로스키

생화학 네트워크의 동역학 모듈이라는 새로운 개념은 이러한 네트워크의 기능 방식에 대한 이해에 혁명을 일으킬 수 있습니다. 포츠담 대학교와 골름에 위치한 막스 플랑크 분자식물생리학 연구소의 과학자들은 동역학 모듈을 통해 생화학 네트워크의 구조와 역학을 연결하는 데 성공하여 오랫동안 미해결 상태였던 시스템 생물학의 문제를 해결했습니다. 그들의 획기적인 연구 결과는 Science Advances 저널에 게재 되었습니다 .

생화학적 네트워크는 세포의 중앙 처리 장치로, 신호를 처리하고 분자를 세포 기능을 지원하는 구성 요소로 변환합니다. 생화학적 네트워크는 세포 내에서 일어나는 화학 반응의 구조와 역학으로 설명됩니다. 이러한 네트워크는 생물정보학적 방법을 사용하여 네트워크 구조를 기반으로 기능적 모듈로 분류되었습니다. 운동 모듈은 네트워크 구조와 역학의 상호작용으로 인해 발생하는 기능적 모듈의 한 유형입니다.

"우리는 생화학적 네트워크의 운동 모듈이 대사산물 농도의 견고성을 어떻게 결정하는지, 그리고 이러한 네트워크의 기능에 어떤 영향을 미치는지 알아내고 싶었습니다."라고 포츠담 대학교 생물정보학 교수이자 막스 플랑크 분자식물생리학 연구소 협동 그룹 리더인 조란 니콜로스키가 설명했습니다. 견고성이란 네트워크가 환경 변화에도 불구하고 대사산물의 농도를 일정하게 유지하는 능력을 의미합니다. 이는 다양한 환경 변화 속에서도 세포의 생존과 성장을 보장합니다.

특정 대사산물 농도의 견고성 저하는 여러 질병의 특징으로 간주됩니다. 연구팀은 반응 속도의 운동적 결합을 기반으로 하는 새로운 개념의 운동 모듈을 사용하여 모델 식물 아라비도프시스 탈리아나, 모델 박테리아 대장균, 모델 균류 사카로미세스 세레비시아를 포함한 26가지 다양한 생물체의 34가지 대사 네트워크 모델을 분석했습니다. 연구진은 운동 모듈이라는 개념을 통해 생화학적 네트워크의 구조와 역학을 성공적으로 연결하여 30년 동안 풀리지 않았던 시스템 생물학 문제를 명확히 했습니다.

니콜로스키는 "우리의 연구 결과는 생명공학 및 의학 분야 에 광범위한 영향을 미칠 것 "이라고 말했습니다. "모듈의 자동 식별을 통해 규제, 신호 및 대사 네트워크 간의 관계에 대한 이해를 심화하고 네트워크 구조를 넘어서는 설계 원칙을 이해할 수 있을 것으로 기대합니다."

추가 정보: Damoun Langary 외, Kinetic modules are sources of concentration robustness in biochemical networks, Science Advances (2025). DOI: 10.1126/sciadv.ads7269 저널 정보: Science Advances 포츠담 대학교 제공

https://phys.org/news/2025-05-kinetic-coupling-dynamics-biochemical-networks.html

메모 2505301334_소스1.분석중【】

_[1】4차 마방진 보기1.을 숫자의 크기 순으로 선분으로 연결할 수 있다. 그러면 그림이 나타나고 독자적 배열의 패턴으로 규정된다.

그런데 만약에 숫자마다 격자의 부피가 2배 (oser) 보기2.처럼 늘어나면 선분을 굵게 나타낼 수 있다. 반응속도가 빠르게 나타난다고 해석될 수 있다.

보기1.
04110613
14051203
15080902
01100716

보기2. oss.one.sum
FEED
CBFB
FFAB
FBEA

보기2.의 oss.one.magicsum은 zero.sum이 기반이고 임의 값의 oss.n.sum 상태를 가질 수 있다. 으음.

_[2】msbase 세포도 엄밀한 의미에서 생화학적 분자구조들은 qpeoms 내에 요소 형태로 네트워크를 가진거다. 세포의 중앙처리는 국소적 qcell 신호를 통해 세포 msbase의 mcell 순서성 네트워크 패턴 기능을 지원한다.

_[3,3-1】
magicsums은 견고성을 지녔다. 환경변화에도 불구하고 수위나 농도 경계나 표준을 일정하게 유지하는 것을 의미한다.

견고성 저하는 질병의 특징으로 수치의 가감 내지 반응의 정도 조절 가능성을 필요로 한다. 어허.

보기2.는 전하의 값으로 생성된 magicsum이다. 전하는 문자로 분자모듈화 된다. 그 결과값은 늘 magicsum의 견고성이다. 농도가 되었든 분자결합의 구조가 되었든, 운동의 반응속도에서도 견고성은 늘 유지된다.

농도 반응속도에 따른 분자 운동 모듈의 결합적 네트워크 모델은 굵은 뚱보선으로 만들어지고 이를 분석한다. 어허.

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