.Mysterious soil virus gene seen for first time
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.Hubble Captures a Spectacular Spiral Dotted With Bright Young Stars
허블, 밝은 젊은 별이 점재하는 장엄한 나선을 포착하다
주제:천문학허블 우주 망원경나사NASA 고다드 우주 비행 센터인기 있는 2022년 9월 18일 NASA 고다드 우주 비행 센터 작성 갤럭시 NGC 1961 약 1억 8천만 광년 떨어진 Camelopardalis 별자리에 있는 은하 NGC 1961의 허블 우주 망원경 이미지. 출처: NASA, ESA, J. Dalcanton(워싱턴 대학교), R. Foley(캘리포니아 대학교 – 산타 크루즈); 이미지 처리: G. Kober(NASA Goddard/미국 가톨릭 대학교)
NASA 의 허블 우주 망원경 에서 새로 공개된 이 놀라운 이미지에서 은하 NGC 1961은 멋진 나선 팔 을 펼치고 있습니다. 반짝이는 어린 별들의 반짝이는 파란색 영역이 은하의 빛나는 중심을 감싸고 있는 먼지투성이의 나선팔에 점을 찍습니다.
NGC 1961은 중간 나선과 AGN 또는 활동 은하 핵, 유형의 은하로 분류됩니다. 중심에 명확하게 정의된 별 막대가 없기 때문에 중간 나선 은하는 "막대" 나선 은하와 "막대 없는" 나선 은하 사이에 있습니다. AGN 은하는 특정 파장의 빛에서 은하의 나머지 부분을 훨씬 능가하는 매우 밝은 중심을 가지고 있습니다. 이 은하들은 중심에 초거대질량 블랙홀이 있어 진화를 형성하는 밝은 제트와 바람을 만들어내는 것으로 믿어집니다.
NGC 1961은 저에너지 하전 입자를 방출하는 상당히 일반적인 유형의 AGN입니다. 이 이미지를 만드는 데 사용된 데이터는 두 가지 제안에서 가져왔습니다. 하나는 이전에 관찰되지 않은 Arp 은하(특이한 은하의 아틀라스라고 불리는 특이한 은하 목록)를 연구한 반면, 다른 하나는 다양한 초신성 의 선조와 폭발을 관찰했습니다 . 약 1억 8천만 광년 떨어져 있는 NGC 1961은 Camelopardalis 별자리에 있습니다.
https://scitechdaily.com/hubble-captures-a-spectacular-spiral-dotted-with-bright-young-stars/
.Mysterious soil virus gene seen for first time
처음 본 신비한 토양 바이러스 유전자
작성자 : David Krause, SLAC 국립 가속기 연구소 400x 배율에서 토양 바이러스 AMG 제품(키토사나제)의 결정. 개별 결정은 구조 분석을 위해 강력한 SSRL X선 빔에 노출되기 전에 액체 질소에서 극저온으로 냉각되었습니다. 크레딧: Clyde Smith/SLAC 국립 가속기 연구소, SEPTEMBER 20, 2022
-소수의 토양에는 수십억 개의 박테리아, 곰팡이 및 바이러스가 있으며 모두 생명주기를 유지하기 위해 노력합니다. 이러한 미생물이 서로 어떻게 상호 작용하는지 이해하면 과학자들이 토양 건강, 토양 탄소 및 영양 순환, 심지어 죽은 곤충이 분해되는 방식을 분석하는 데 도움이 됩니다. 토양 바이러스에는 일부 대사 기능이 있는 것으로 보이는 유전자가 포함되어 있지만 정상적인 바이러스 복제에는 분명히 필요하지 않습니다.
-이러한 유전자를 보조 대사 유전자(AMG)라고 하며 단백질을 생산하며 그 중 일부는 다양한 기능을 하는 효소입니다. 지금까지 과학자들은 일부 AMG 단백질이 탄소 순환과 같은 중요한 토양 과정에서 역할을 하는지 궁금해했습니다. 토양 AMG에 대해 더 알아보기 위해 연구자들은 특정 AMG에 의해 발현되는 단백질의 원자 구조를 결정했습니다. 특히, 연구자들은 에너지부(DOE) SLAC 국립 가속기 연구소의 스탠포드 싱크로트론 방사선 광원(SSRL) 빔 라인 12-2에서 생성된 고휘도 X선으로 깨지기 쉬운 결정화된 단백질 샘플을 조사했습니다.
-X선은 결정 샘플 내의 단백질을 공격하여 분자 구조 와 구성 뒤에 숨겨진 약간의 미스터리를 드러냈습니다. AMG는 많은 바이러스 유전자와 마찬가지로 바이러스 복제를 돕지 않습니다. 대신, 그들은 각각의 예측된 기능을 가진 다양한 단백질을 암호화합니다. 발현된 AMG는 토양이 생물권에서 탄소를 처리하고 순환시키는 데 핵심적인 역할을 하는 추정되는 효소였습니다. SSRL 수석 연구원이자 공동 저자인 Clyde Smith는 "우리는 바이러스 단백질에서 모든 원자의 위치를 보았고 이것이 어떻게 기능하는지 알아내는 데 도움이 됩니다"라고 말했습니다.
-"우리는 단백질이 관련된 박테리아 및 곰팡이 효소 계열의 알려진 원자 구조와 유사하지만 완전히 새로운 조각을 포함한다는 사실에 놀랐습니다." 상세한 원자 구조는 전례가 없으며 토양 생태학에서 중요한 역할을 할 수 있는 이 새로운 효소의 잠재적인 메커니즘을 처음으로 드러냅니다. Janet K. Jansson, DOE의 태평양 북서부 국립 연구소(PNNL) 수석 과학자이자 공동 저자 , 말했다.
Jansson은 "SLAC와의 협력을 통해 이전에는 알려지지 않은 토양 바이러스가 수행하는 기능을 해독할 수 있었습니다."라고 말했습니다. SSRL, PNNL 및 DOE 로렌스 버클리 국립 연구소의 JGI(Joint Genome Institute) 연구팀은 오늘 네이처 커뮤니케이션즈 (Nature Communications)에 결과를 발표했습니다 .
키토사나제로 알려진 효소인 토양 바이러스 AMG 제품의 3차원 구조. 키토사나아제는 2개의 구조적 도메인(녹색의 도메인-1 및 분홍색의 도메인-2)으로 구성됩니다. 화학 반응이 일어나는 활성 부위는 4개의 노란색 및 빨간색 막대로 강조 표시됩니다. 크레딧: Clyde Smith/SLAC 국립 가속기 연구소
키틴 분해 연구원들은 연구에서 바이러스 AMG가 키틴에 분해 반응을 수행하는 효소를 인코딩한다고 생각합니다. 키틴은 셀룰로오스 다음으로 지구에서 두 번째로 풍부한 탄소 생체 고분자이며 곤충의 외골격과 대부분의 곰팡이 세포벽의 일부입니다. 연구에서 바이러스 AMG는 키토사나제 단백질로 알려져 있으며, 서열 분석에서 글리코실 가수분해효소 GH75 계열의 구성원으로 확인되었습니다. 이 단백질은 토양을 위한 정원 괭이처럼 작용할 수 있습니다. 즉, 채소, 나무, 꽃 및 기타 모든 종류의 생명체를 위한 토양을 준비하는 데 도움이 되는 도구입니다. 키토사나제 단백질의 원자 구조를 캡처하려면 결정 샘플에서 가져온 5,000개 이상의 이미지가 필요했습니다.
이 이미지를 종합하면 단백질 구조의 일부가 글리코실 가수분해효소 GH45 계열의 알려진 탄수화물 대사 효소 그룹과 유사하다는 것이 밝혀졌습니다. 그러나 키토사나제 단백질에는 GH45 또는 알려진 다른 단백질 구조에서 발견되지 않는 다른 분자 조각이 포함되어 있어 토양 순환에서 그 역할이 더 많은 연구에 열려 있다고 Smith가 말했습니다.
"완전히 새롭고 참신한 효소의 일부가 있습니다. 이것이 구조 생물학자인 저에게 흥미로운 것입니다. 우리가 전에 보지 못한 것을 보고 그 역할이 무엇인지 알아 내려고 노력하는 것입니다."라고 Smith는 말했습니다. Smith는 향후 연구를 통해 AMG가 바이러스 복제를 돕지 않기 때문에 애초에 존재하는 이유를 이해할 수 있을 것이라고 말했습니다. 또한 연구자들은 토양 바이러스가 운반하는 다른 AMG와 토양 생태계에서 기능적 역할을 하는지 여부에 대해 더 많이 알 수 있습니다.
Smith는 "이 발견에서 오는 큰 질문 중 하나는 "토양에서 키틴의 탄소가 필요한 것은 무엇입니까?"입니다. 이와 같은 질문에 대한 답은 많은 미생물의 상호 작용에 대한 더 깊은 이해로 이어질 것입니다. 토양, 영양소와 필수 분자의 이동, 토양의 전반적인 건강 . "
추가 탐색 과학자들은 새로운 토양 바이러스를 발견 추가 정보: Ruonan Wu et al, 토양 바이러스 보조 대사 유전자 산물의 구조적 특성화 - 기능성 키토사나제, Nature Communications (2022). DOI: 10.1038/s41467-022-32993-8 저널 정보: 네이처 커뮤니케이션즈 SLAC 국립가속기연구소 제공
https://phys.org/news/2022-09-mysterious-soil-virus-gene.html
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메모 2209210456 나의사고실험 oms 스토리텔링
토양 바이러스에는 일부 대사 기능이 있는 것으로 보이는 유전자가 포함되어 있지만 정상적인 바이러스 복제에는 분명히 필요하지 않다. 이러한 유전자를 보조 대사 유전자(AMG)라고 하며 단백질을 생산하며 그 중 일부는 다양한 기능을 하는 효소이다.
참고로,
효소란 생명체내에서의 모든 대사작용을 원활하게 촉진하는 '생체 촉매'이다. 즉, 효소는 우리몸속에서의 소화작용은 기본이며, 외부침입균에 대항하는 면역작용 및 치 유작용 등을 비롯하여 노화방지 작용이라던지 항암작용까지에도 직접 관여하여 중요 한 역할을 한다.
효소가 유사 유전자의 역할분담 요소를 가진 것은 샘플b.qoms가 샘플a.oms의 단위 역할을 가지는 경우이고 이는 샘플b.poms의 거대소수의 단위와 그 소인수분해 단위의 모습과 유사하다. 물론 이들이 원자적 혹은 분자적인 수준이면 샘플c.oss는 거의 생물의 개체적 수준의 모습이다. 허허.
샘플a.oms(standard)
b0acfd 0000e0
000ac0 f00bde
0c0fab 000e0d
e00d0c 0b0fa0
f000e0 b0dac0
d0f000 cae0b0
0b000f 0ead0c
0deb00 ac000f
ced0ba 00f000
a0b00e 0dc0f0
0ace00 df000b
0f00d0 e0bc0a
샘플b.qoms(standard)
0000000011=2,0
0000001100
0000001100
0000010010
0001100000
0101000000
0010010000
0100100000
2000000000
0010000001
샘플b.poms(standard)
q0000000000
00q00000000
0000q000000
000000q0000
00000000q00
0000000000q
0q000000000
000q0000000
00000q00000
0000000q000
000000000q0
샘플c.oss(standard)
zxdxybzyz
zxdzxezxz
xxbyyxzzx
zybzzfxzy
cadccbcdc
cdbdcbdbb
xzezxdyyx
zxezybzyy
bddbcbdca
- There are billions of bacteria, fungi and viruses in a handful of soils, all working to sustain their life cycle. Understanding how these microbes interact with each other will help scientists analyze soil health, soil carbon and nutrient cycles, and even how dead insects are decomposed. Soil viruses contain genes that appear to have some metabolic function, but are clearly not required for normal viral replication.
-These genes are called auxiliary metabolic genes (AMGs) and produce proteins, some of which are enzymes with multiple functions. Until now, scientists have wondered if some AMG proteins play a role in important soil processes such as the carbon cycle. To learn more about soil AMG, researchers determined the atomic structure of the protein expressed by a specific AMG. Specifically, the researchers irradiated brittle, crystallized protein samples with high-intensity X-rays generated by the Stanford Synchrotron Radiation Source (SSRL) beamline 12-2 at the Department of Energy (DOE) SLAC National Accelerator Laboratory.
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Memo 2209210456 My Thought Experiment oms Storytelling
Soil viruses contain genes that appear to have some metabolic function, but are clearly not required for normal viral replication. These genes are called auxiliary metabolic genes (AMGs) and produce proteins, some of which are enzymes with multiple functions.
Note that,
Enzymes are 'biological catalysts' that facilitate all metabolic reactions in living things. In other words, enzymes are fundamental to digestion in our body, and they play an important role by directly participating in anti-aging and anti-cancer actions as well as immune and healing actions against invading bacteria.
The enzyme has a role sharing element of a similar gene when sample b.qoms has the role of a unit of sample a.oms, which is similar to the appearance of a unit of a large prime number and its prime factorization unit of sample b.poms. Of course, if they are at the atomic or molecular level, the sample c.oss is almost the appearance of an organism at the individual level. haha.
Sample a.oms (standard)
b0acfd 0000e0
000ac0 f00bde
0c0fab 000e0d
e00d0c 0b0fa0
f000e0 b0dac0
d0f000 cae0b0
0b000f 0ead0c
0deb00 ac000f
ced0ba 00f000
a0b00e 0dc0f0
0ace00 df000b
0f00d0 e0bc0a
sample b.qoms(standard)
0000000011=2,0
0000001100
0000001100
0000010010
0001100000
0101000000
0010010000
0100100000
2000000000
0010000001
sample b.poms(standard)
q0000000000
00q00000000
0000q000000
000000q0000
00000000q00
000000000q
0q000000000
000q0000000
00000q00000
0000000q000
000000000q0
sample c.oss(standard)
zxdxybzyz
zxdzxezxz
xxbyyxzzx
zybzzfxzy
cadccbcdc
cdbdcbdbb
xzezxdyyx
zxezybzyy
bddbcbdca
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