.A single cell type map of human tissues

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인간 조직의 단일 세포 유형 지도

에 의해 웁살라 대학 Karlsson et al(2021)의 간행물에서 분석된 일부 주요 인간 세포 유형 간의 관계. 크레딧: 인간 단백질 아틀라스JULY 30, 2021

-미국 저널 Science Advances에 발표된 연구에서 인간 조직의 단일 세포 유형 지도가 제시되었습니다. 연구자들이 이러한 조직의 모든 단백질 코딩 유전자에 대한 개별 단일 세포 유형의 발현을 탐색할 수 있도록 250,000개 이상의 대화형 플롯이 포함된 오픈 액세스 아틀라스가 출시되었습니다. 새로운 지식 포털은 단일 세포 데이터와 항체 기반 프로파일링을 결합하여 스웨덴에 기반을 둔 Human Protein Atlas 프로그램(www.proteinatlas.org)의 일부로 만들어졌습니다.

어 크로스 단백질 인간의 몸은 인간의 생물학 및 질병 연구를위한 기초 역할을합니다. 단일 세포 샘플 준비 및 데이터 디콘볼루션과 결합된 대규모 병렬 시퀀싱의 극적인 개선으로 인해 단일 세포 RNA 시퀀싱이 단일 세포 를 특성화하는 강력한 접근 방식이 되었습니다 . Karlsson et al의 논문에서 RNA 시퀀싱과 항체 기반 프로파일링을 모두 사용하는 단일 세포 분석을 결합하여 192개 인간 세포 유형의 공개 맵을 생성했습니다.

유사한 기능을 공유하는 세포 유형 분석은 동일한 기관 내에서 그리고 기관 간에 유사한 기능을 공유하는 세포 유형에 해당하는 뚜렷한 발현 클러스터를 강조합니다. 다른 세포 유형에 걸쳐 모든 단백질 코딩 유전자 의 유전자 발현 프로파일을 매핑하기 위한 분류를 수행하여 특정 단일 세포 유형에서 상승되어 높은 또는 낮은 세포 유형 특이성을 나타내는 유전자의 수를 결정했습니다. 분석된 모든 세포 유형에서 거의 14,000개의 유전자가 특정 세포 유형에서 증가된 발현을 보였으며 그 중 약 2,000개의 유전자가 세포 유형 중 하나에만 특이적인 것으로 밝혀졌습니다.

-고환의 세포 유형이 가장 많은 수의 세포 유형 상승 유전자를 보였고 섬모 세포가 그 뒤를 이었습니다. 흥미롭게도, 분석된 모든 세포 유형에서 유전자의 11%만이 검출되었으며, 이는 필수 유전자('하우스 키핑')의 수가 놀라울 정도로 적다는 것을 시사합니다.

"이 논문은 모든 인간 단백질 코딩 유전자에 대한 정보가 포함된 수백만 웹 페이지를 보유하고 있는 세계에서 가장 많이 방문한 생물학적 데이터베이스 중 하나가 된 Human Protein Atlas에 대한 중요한 추가 사항에 대해 설명합니다."라고 Human Protein Atlas의 이사인 Mathias Uhlén이 말했습니다. 프로틴 아틀라스 컨소시엄. HPA 조직 프로파일링 그룹의 책임자인 Cecilia Lindskog 박사는 "새로운 개방형 액세스 단일 세포 유형 섹션이 모든 단백질의 세포 유형 특이성과 정확한 공간적 위치를 연구하기 위한 고유한 리소스를 구성하게 된 것을 기쁘게 생각합니다."라고 말했습니다.

추가 탐색 연구원들은 현재까지 가장 포괄적인 RNA 아틀라스를 개발합니다. 추가 정보: Max Karlsson et al, A single-cell type transcriptomics map of human tissue, Science Advances (2021). DOI: 10.1126/sciadv.abh2169 저널 정보: 과학 발전 웁살라대학교 제공

https://phys.org/news/2021-07-cell-human-tissues.html

===메모 2107310440 나의 사고실험 oms스토리텔링

샘플1/oms//의 vix_abcdef는 각자 서로다른 유전자로 비유될 수 있다. 이때 이들 유전자를 공유하는 세포는 지도화 시킬 수 있다. 이들이 전체 유전자의 10퍼센트 미만으로 나타내는 경우수는 인간의 세포가 다른 종류의 생명체의 세포와 다른 점이 있을거여.

더 나아가 다른 종류의 세포들이 각자의 도생하며 유전자의 샘플1/oms//의 vix_bar(abcdef...)이 존재하며 특히 유전자가 많이 포함된 성세포는 좁은 통로에 압축된 더많은 미세 유전자들이 암호로 90퍼센트의 잠재된 유전자을 암시할 수 있다. 그리고 이런 세포 유전자맵 지식을 바탕으로 인공적인 세포를 만들어 유전자를 조작하는 방식으로 우주시대에 인간두뇌를 가지고 화성인이나 유로파인 엔셀라두스인들을 개조할 수 있으리라. 허허.

>>>>iii 정말 큰일 납니다 큰일나..콧바람 묘술로 이런 막무가내 주장을 자연스럽게 하신다니 놀랍습니다. 연륜과 내공으로 인간을 유로파인으로 뚝딱 만들 수 있다니..정말 기가 찹니다.
<<<< 믿어지지 않으면 꺼지세요. 쩌어업!

샘플1/oms//
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000ac0 f00bde
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d0f000 cae0b0
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0deb00 ac000f
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0ace00 df000b
0f00d0 e0bc0a

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-A single cell type map of human tissue was presented in a study published in the American journal Science Advances. An open access atlas containing more than 250,000 interactive plots has been released to enable researchers to explore the expression of individual single cell types for all protein-coding genes in these tissues. The new knowledge portal was created as part of the Sweden-based Human Protein Atlas program (www.proteinatlas.org), combining single-cell data with antibody-based profiling.

Ercross Protein The human body serves as the basis for the study of human biology and disease. Dramatic improvements in massively parallel sequencing combined with single-cell sample preparation and data deconvolution have made single-cell RNA sequencing a powerful approach to characterize single cells. In a paper by Karlsson et al, single-cell analysis using both RNA sequencing and antibody-based profiling was combined to generate public maps of 192 human cell types.

Analysis of cell types that share similar functions highlights distinct expression clusters that correspond to cell types that share similar functions within and between organs. Sorting was performed to map the gene expression profiles of all protein-coding genes across different cell types to determine the number of genes that were elevated in a particular single cell type and exhibited high or low cell type specificity. In all cell types analyzed, nearly 14,000 genes showed increased expression in specific cell types, of which approximately 2,000 genes were found to be specific to only one cell type.

-The testicular cell type showed the highest number of cell type-elevating genes, followed by ciliary cells. Interestingly, only 11% of the genes were detected in all cell types analyzed, suggesting that the number of essential genes ('housekeeping') is surprisingly low.

===Memo 2107310440 My Thought Experiment oms Storytelling

The vix_abcdef of sample 1/oms// can be compared to different genes. Cells that share these genes can then be mapped. The number of cases in which they represent less than 10% of the total number of genes makes human cells different from cells of other types of living organisms.

Furthermore, different types of cells develop their own, and vix_bar(abcdef...) of sample 1/oms// of genes exists. It can suggest the percentage of latent genes. And by manipulating genes by creating artificial cells based on this knowledge of the cell gene map, we will be able to remodel Martians or Europa Enceladus with human brains in the space age. haha.

>>>>iii It's going to be a really big deal. To be able to make a human into a Europine with age and skill.. I'm really excited.
<<<< If you don't believe it, turn it off. Wow!

sample1/oms//
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0deb00 ac000f
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.Italian astronomers discover new star cluster

이탈리아 천문학자들, 새로운 성단 발견

작성자: Tomasz Nowakowski, Phys.org YMCA-1을 중심으로 한 1.5' × 1.5' 크기의 G-band 하늘 이미지. 출처: Gatto et al., 2021.JULY 29, 2021 REPORT

이탈리아의 천문학자들은 YMCA(Yes, Magellanic Clouds Again) 조사의 일환으로 새로운 성단의 발견을 보고했습니다. YMCA-1로 명명된 새로 발견된 항성 그룹은 우리 은하의 멀리 떨어져 있는 오래된 성단일 수 있습니다. 이 발견은 arXiv 인쇄 전 리포지토리에 7월 21일에 게시된 논문에 자세히 설명되어 있습니다.

-성단은 공통의 기원을 공유하고 일정 시간 동안 중력에 의해 묶인 별의 그룹입니다 . 그것들은 항성 진화 과정을 연구하고 모델링하는 데 도움이 될 수 있기 때문에 천문학자들에게 중요합니다. 일반적으로 성단 은 산개성단과 구상성단의 두 가지 광범위한 범주로 나뉩니다 .

YMCA는 대마젤란운과 소마젤란운(LMC 및 SMC)의 외곽을 탐사하기 위해 2.6m VLT 측량 망원경(VST)으로 수행되는 광학 측량입니다. YMCA의 목표 중 하나는 LMC와 SMC 주변의 성단과 같은 알려지지 않은 항성계를 찾는 것입니다. 지금까지 조사에서는 LMC와 그 주변에서 약 80개의 클러스터를 발견했습니다. 이제 이탈리아 나폴리 페데리코 II 대학의 Massimiliano Gatto가 이끄는 천문학자 팀이 YMCA 데이터에서 새로운 성단 을 발견했다고 보고합니다 .

YMCA-1이라는 명칭을 받은 새로운 클러스터는 YMCA 조사의 측광 데이터에서 소규모 과밀도를 검색하는 동안 식별되었습니다. YMCA-1은 LMC 중심에서 동쪽으로 약 13도 떨어진 곳에 위치한 카탈로그되지 않은 항성계로 처음 발견되었습니다. 이 별의 과밀도는 국부 배경에 대해 12.2 시그마의 중요성을 가지며 별 덩어리로 쉽게 볼 수 있습니다. 데이터를 통해 팀은 YMCA-1의 기본 매개변수를 얻을 수 있었습니다. 성단의 나이는 약 126억년이며 금속이 -2.0 수준인 금속이 부족한 것으로 밝혀졌습니다. 이 시스템은 우리 은하의 중심에서 약 342,000광년 떨어져 있으며 반광반경은 약 15.6 광년으로 추정됩니다 .

연구원들에 따르면, 그 결과는 YMCA-1이 우리은하의 오래되고 멀리 떨어진 성단일 수 있음을 시사합니다. 이 가설이 사실이라면 은하 중심 거리가 비슷한 다른 성단과 비교하여 다소 특이한 특성을 가지고 있음을 의미합니다. "이 시나리오가 확인될 수 있다면 그 성단은 은하 후광의 극단 외곽에 있는 알려진 대부분의 성단보다 훨씬 더 희미하고 더 조밀할 것이지만 Laevens 3와 매우 유사합니다. (...) YMCA-1 지금까지 발견된 가장 희미한 성단 중 하나일 수 있으며 [은하 중심에서] 50kpc를 넘어서는 가장 작은 성단이 될 수 있습니다."라고 논문의 저자는 설명했습니다. 그러나 YMCA-1의 특성을 확인하고 그 거리를 안정적으로 추정하기 위해서는 후속 심층 측광 관측이 필요하다.

https://phys.org/news/2021-07-italian-astronomers-star-cluster.html

===메모 2107310440 나의 사고실험 oms스토리텔링

샘플1/oms//의 vix_a를 성단으로 볼 수 있다. 그렇다면 샘플1.은 6개의 성단으로 이뤄 전체적으로 샘플1. 12차 oms은하단이라 명할 수 있다. 이들 성단은 위치가 무수히 바뀔 수 있다. 그리고 새로운 성단의 발견은 무수히 이뤄질 것이다. 샘플1,이 12차이면 13차 14차, 15억차 oms성단도 얼마든지 있을 수 있기 때문이다.

샘플1/oms//
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f000e0 b0dac0
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0deb00 ac000f
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- A star cluster is a group of stars that share a common origin and are held together by gravity for a period of time. They are important to astronomers because they can help study and model the processes of stellar evolution. In general, clusters fall into two broad categories: open clusters and globular clusters.

===Memo 2107310440 My Thought Experiment oms Storytelling

Vix_a of sample 1/oms// can be seen as a star cluster. Then, Sample 1. consists of 6 star clusters, and as a whole, Sample 1. It can be called the 12th oms galaxy cluster. These clusters can change position countless times. And the discovery of new star clusters will happen countless times. This is because if sample 1, is the 12th order, there can be any number of 13th, 14th, and 1.5 billionth oms clusters.

sample1/oms//
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0deb00 ac000f
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.Senescent tumor cells building three-dimensional tumor clusters

3 차원 종양 클러스터를 구축하는 노화 종양 세포

논문저자 이현규1, 논문저자 고려대 이현규 Hyun-Gyu Lee1,

June Hoan Kim 2, Woong Sun 2, Sung-Gil Chi3, WonshikChoi 1,4 & Kyoung J. Lee1 ,Scientific Reports volume 8 , 문서 번호 : 10503 ( 2018 ) | 인용문 다운로드 추상 세포 노화 (영구적 인 세포주기 정지)는 생물학적 유기체에 대한 유익한 중요성이 아직 탐구되기 시작한 공통적 인 흥미로운 현상입니다. 다른 한편으로는, 노화 세포는 그들 주위의 조직 구조를 변형시킬 수있다. 무한히 증식 할 수있는 능력을 가진 종양 세포는 그 현상으로부터 자유롭지 못합니다. 여기에 우리는 유방암 식민지의 고밀도 단일 층에있는 노화 세포가 주변에있는 비 노화 세포의 집합 센터 역할을하는 놀라운 관찰을보고합니다. 결과적으로, 노화 세포는 융합 성인 2D 종양 층에서 국소화 된 3D 세포 - 클러스터를 활발히 형성한다. 놀라운 현상을 뒷받침하는 생물 리 학적 메커니즘은 주로 유사 분열 세포 반올림, 동적 및 차동 세포 부착 및 세포 주 화성을 포함한다. 이러한 몇 가지 생물 물리학 적 요소를 통합함으로써 우리는 세포 Potts 모델을 통해 실험 관측을 재현 할 수있었습니다.

소개

세포 노화는 증식하는 세포가 완전한 성장 억제에 들어가고 그 체적을 극적으로 팽창시키는 (일반적으로, 2 차원 기질에서 튀긴 알 의 형태로) 생물체에서 공통적 인 현상이다 . 이 세포 상태의 근원은 강하게 연구되어왔다. 그러나 그 기본 메커니즘은 명확하지 않다. 1 , 2. 중요하게 노화 세포는 노화 관련 분비 표현형 (SASPs)으로 총체적으로 분류되는 다수의 분비물을 통해 그 이웃과 상호 작용한다. 이러한 분비 표현형은 생물에 부정적인 영향을 미치는 다양한 생물학적 과정에 관여하는 것으로 알려져있다. 예를 들어, 주위의 악성 종양 세포의 성장을 자극하는 친 염증성 사이토 카인과 케모카인이 그 중 3 개 , 4 개 입니다. 노화 세포의 축적은 또한 나이 - 관련 질환과 같은 더 많은 유기체 레벨 부작용과 연관된 5. 특히 조직 개조를 촉진 할 수도 있습니다. 예를 들어, 일부 세포 노화 따라서 암세포의 침윤 촉진 소프 주변 조직 구조를 만드는 세포 외 매트릭스 저하 프로테아제를 분비 6 , 7 , 8 . 한편, 노화 세포에 대한 유익한 효과에 대해서도 최근 논의된다. SASP는 배아 패터닝 9 , 10 및 상처 치료 11에 기여하는 단백질을 포함 합니다. 그럼에도 불구하고 이러한 조직 재생 효과가 SASP에 의해 생물 물리학 적으로 조율되는 방법의 정확한 성격은 특히 조직에 대한 개별 세포의 규모에서 많이 연구되어야합니다. 이 논문에서는 단일 클론 세포주 인 MDA-MB-231 (널리 사용되는 악성 유방암 세포주)의 시험 관내 배양을 바탕으로 초기 시딩 및 이웃 노화 방지와의 상호 작용에서 신생 세포의 출현을 신중하게 분석합니다 세포. 놀랍게도, 불멸화 된 종양 세포조차도 노화를 일으키는 것으로 나타났습니다 12 . 더 흥미 진진한 것은 노화 된 MDA-MB-231 세포가 인접한 종양 세포에 대한 인력의 중심 역할을하여 처음에 2 층 (2D) 콜로니의 단층에서 3 차원 (3D ) 세포 클러스터. 우리는 전환 이 시험 관내 에서 명확한 것으로 나타남을 본다.예를 들어 노화 세포가 조직 개질에 관여 할 수있는 사례. 또한 몇 가지 필수 메커니즘만으로 통합 된 컴퓨터 모델을 통한 관찰에 대한 경험적 설명을 제공합니다. Metropolis kinetics에서 작동하는 셀룰러 Potts 모델 (CPM)은 세포 부피의 보존, 유사 분열 세포 반올림 (결과적으로 세포 - 환경 유착의 동적 강도)과 같은 생물 물리학 적 과정을 재현하는 것을 목표로하며, 세포의 주 화성 운동. 실험 결과 MDA-MB-231 세포 배양 물 (처음에는 직경 2mm의 디스크 영역에 균일하게 도금 된 합류 단일 층 (confluent mono layer),도 1a 참조, 방법에 대한 자세한 내용 참조)은 다수의 노화 세포가 전체 집단으로 무작위로 출현한다 시간이 지남에 따라 증가한다 (그림 1b ). 그들은 '튀긴 계란'형태로 쉽게 식별 할 수 있습니다 (그림 1c ). 노화 된 상태로 들어가는 세포의 몸체는 꽤 합류하는 인구 내에서도 거대한 지역을 차지하기 위해 며칠 동안 측면으로 팽창합니다 (그림 1c ). 완전히 개발 노화 세포의 점유 면적이 현저하게 다른 하나에서 다를 수 있지만, 일반적으로 1.4 × 10 종종 크고 매우 큰 수 5 μ m (2) (도. 참조 1D를) - 전형적인 비 노화 세포보다 약 3 배 더 크다. 반면에 노화 세포의 몸은 ~ 2 μ m 만큼 얇 습니다 (그림 1e 의 두 측면보기 참조 ). 신체는 f-actin의 조밀 한 네트워크에 의해 구조적으로 잘 유지됩니다 (그림 1e 의 상단 그림 참조 ). 세포가 갑자기 파열되어 대사 과정을 끝낼 때까지 끊임없는 시공간 파동이 몸 전체에 나타나며 핵쪽으로 향하게됩니다.

https://www.nature.com/articles/s41598-018-28963-0

https://www.nature.com/articles/s41598-018-28963-0.pdf

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