.Photonic hopfions: Light shaped as a smoke ring that behaves like a particle
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.Photonic hopfions: Light shaped as a smoke ring that behaves like a particle
Photonic hopfions: 입자처럼 행동하는 연기 고리 모양의 빛 SPIE 에 의해 빛은 꼬인 연기 고리와 유사한 구조로 형성될 수 있습니다
크레딧: Y. Shen 및 Z. Zhu.
-우리는 일상 생활에서 퍼짐에 따라 모양을 유지하는 국부적인 파동 구조를 자주 발견할 수 있습니다. 예를 들어 연기 고리가 공중에 떠 있는 것을 상상해 보십시오. 유사한 안정 구조가 다양한 연구 분야에서 연구되었으며 자석, 핵 시스템 및 입자 물리학에서 찾을 수 있습니다. 연기의 고리와는 대조적으로 그들은 섭동에 탄력적으로 만들 수 있습니다. 이것은 수학 및 물리학에서 위상 보호로 알려져 있습니다.
-전형적인 예는 스커미온(skyrmion)이라 불리는 입자처럼 행동하는(즉, 모양이 변하지 않는) 자성 박막의 자기장의 나노스케일 허리케인과 같은 질감입니다. 파동의 다양한 특성의 복잡한 공간 분포를 시각화하는 3D 공간의 유사한 도넛 모양(또는 토로이달) 패턴을 홉피온이라고 합니다. 광파 로 이러한 구조를 달성 하는 것은 매우 어렵습니다. 구조광에 대한 최근의 연구는 편광, 위상 및 진폭의 강력한 공간적 변화를 보여 입자처럼 거동하는 위상적으로 안정적인 광학 구조를 이해하고 설계할 수 있는 기회를 열어줍니다. 다양한 토폴로지 특성을 제어하는 이러한 빛의 준입자는 예를 들어 양자 기술뿐만 아니라 초대형 광 정보 전송을 위한 차세대 정보 캐리어로서 큰 잠재력을 가질 수 있습니다.
Advanced Photonics 에 보고된 바와 같이 , 영국과 중국의 협력 물리학자들은 최근 3차원에서 위상적으로 안정적인 특성을 설계한 편광 패턴의 생성을 시연했으며, 처음으로 자유 공간에서 제어 가능하게 변형되고 전파될 수 있습니다. (a) 스핀을 작동 조작-공간 구: 작동 조작 2구의 수직 및 위도 각도(α 및 β)는 건축 색상과 낮(스핀이 아래로 향하는 남극 계단 상태 및 완전음)으로 표시됩니다. 스핀이 윗인 노스게이트). 파라메트릭 2구의 각막 점은 3D 유클리드 공간에 펼쳐진 트윈 iso-spin 선에 해당합니다. (b) 하이퍼스피어의 수직 위도 β 및 다른 직각 α의 선택된 점에서 깎인 선(해당 건축자재 색상이 있는 점 점으로 강조표시됨)은 토러스를 덮는 토러스 생산을 형성합니다(다른 β에 해당하는 다른 토러스 포함) ). . (c) 하이퍼스피어로부터의 전체 벽체 상황의 Hopf 피브레이션의 실제 공간은 동축으로 그려진 토리 세트에 매달린 토러스 표시, 각 토러스는 플로어메트릭 2구의 서로 다른 위도 β에 해당합니다.
검은색 원은 (a)에서 남극(스핀 다운)에 해당하고 나타난 토리의 축은 남북(스핀 업)에 해당합니다. (d) 인서트에 연장대로 (a)에서 파라메트릭 구의 α 및 β-엽으로 색이 표준 스핀 벡터와 함께 (c)의 아이소스핀에 해당하는 홉피온의 3D 스핀각 수축. (e, f) (d)의 스핀 조작 법원: (e) xy(z = 0) 및 (f) yz(x = 0) 외관은 회색 화살표가 있는 스커미온 구조 유사를 보여줍니다. skyrmions의 소용돌이를 표시합니다. 색상 물리적은 (d)의 스핀 방향에 해당하는 것과 동일합니다.크레딧: Shen et al., doi 10.1117/1.AP.5.1.015001 검은색 원은 (a)에서 남극(스핀 다운)에 해당하고 중첩된 토리의 축은 북극(스핀 업)에 해당합니다. (d) 인서트에 표시된 대로 (a)에서 파라메트릭 구의 α 및 β 매개변수로 색상이 지정된 각 스핀 벡터와 함께 (c)의 아이소스핀 윤곽에 해당하는 홉피온의 3D 스핀 분포. (e, f) (d)의 스핀 분포 단면도: (e) xy(z = 0) 및 (f) yz(x = 0) 단면은 회색 화살표가 있는 스커미온 유사 구조를 보여줍니다. skyrmions의 소용돌이를 표시합니다. 컬러 스케일은 (d)의 스핀 방향에 해당하는 것과 동일합니다. 크레딧: Shen et al., doi 10.1117/1.AP.5.1.015001 검은색 원은 (a)에서 남극(스핀 다운)에 해당하고 중첩된 토리의 축은 북극(스핀 업)에 해당합니다. (d) 인서트에 표시된 대로 (a)에서 파라메트릭 구의 α 및 β 매개변수로 색상이 지정된 각 스핀 벡터와 함께 (c)의 아이소스핀 윤곽에 해당하는 홉피온의 3D 스핀 분포. (e, f) (d)의 스핀 분포 단면도: (e) xy(z = 0) 및 (f) yz(x = 0) 단면은 회색 화살표가 있는 스커미온 유사 구조를 보여줍니다. skyrmions의 소용돌이를 표시합니다. 컬러 스케일은 (d)의 스핀 방향에 해당하는 것과 동일합니다. 크레딧: Shen et al., doi 10.1117/1.AP.5.1.015001 인서트에 표시된 것처럼 (a)의 파라메트릭 구의 α 및 β 매개변수로 색상이 지정된 각 스핀 벡터를 사용하여 (c)의 아이소스핀 윤곽에 해당합니다. (e, f) (d)의 스핀 분포 단면도: (e) xy(z = 0) 및 (f) yz(x = 0) 단면은 회색 화살표가 있는 스커미온 유사 구조를 보여줍니다. skyrmions의 소용돌이를 표시합니다. 컬러 스케일은 (d)의 스핀 방향에 해당하는 것과 동일합니다. 크레딧: Shen et al., doi 10.1117/1.AP.5.1.015001 인서트에 표시된 것처럼 (a)의 파라메트릭 구의 α 및 β 매개변수로 색상이 지정된 각 스핀 벡터를 사용하여 (c)의 아이소스핀 윤곽에 해당합니다. (e, f) (d)의 스핀 분포 단면도: (e) xy(z = 0) 및 (f) yz(x = 0) 단면은 회색 화살표가 있는 스커미온 유사 구조를 보여줍니다. skyrmions의 소용돌이를 표시합니다. 컬러 스케일은 (d)의 스핀 방향에 해당하는 것과 동일합니다. 크레딧: Shen et al., doi 10.1117/1.AP.5.1.015001 컬러 스케일은 (d)의 스핀 방향에 해당하는 것과 동일합니다. 크레딧: Shen et al., doi 10.1117/1.AP.5.1.015001 컬러 스케일은 (d)의 스핀 방향에 해당하는 것과 동일합니다. 크레딧: Shen et al., doi 10.1117/1.AP.5.1.015001
-이러한 중대한 결과로 몇 가지 중요한 발전과 새로운 관점이 제공됩니다. "우리는 전기와 심판 숫자가 풀리고 기준으로 조정될 수 있는 3D 재활성 솔리톤의 새롭고 매우 생생한 구조화된 조명 제품군을 보고합니다. 이 논문의 주저자인 영국 사우샘프턴 대학교의 Yijie Shen은 말합니다. "우리의 결과는 광 구조의 엄청난 아름다움을 보여줍니다. 광통신, 양자 기술, 광 물질 상호 작용, 초고해상도 현미경 및 계측에서 위상 보호 광 구성의 잠재적 응용에 대한 추가 조사에 영감을 주기를 바랍니다."라고 교수인 Anatoly Zayats는 말합니다. King's College London에서 프로젝트를 이끌고 있습니다. 이 작업은 이 홉피온의 작업과 적 생성 및 권리화를 설명하는 작업자 배경을 제공하여 기술적으로 보호되는 탱크 작업자의 인력 구조를 보여줍니다. 표준물질에 축소된 홉피온의 이전 관찰과 작업, 이 작업은 반직관적으로 광학 홉피온 이 전기통의 축소 된 보호를 통해 자유 공간에서 끌어낼 수 있음을 보여줍니다. 프록시된 광자 홉피온의 수요자 토폴로지는 종종 응용 분야에서 열립니다. 이 새로 개발된 광학 위상 홉피온 모델은 물리학의 다른 분야에서 다른 고차 위상 구조로 쉽게 확장될 수 있습니다. 고차 홉피온은 고에너지 물리학에서 자성 물질에 이르기까지 다른 물리학 커뮤니티에서 관찰하기에는 여전히 큰 도전입니다. 이 작업에서 제안된 광학적 접근 방식은 다른 물리학 분야의 복잡한 구조 분야에 대한 더 깊은 이해를 제공할 수 있습니다.
추가 정보: Yijie Shen 외, 광자 홉피온의 위상 변환 및 자유 공간 전송, Advanced Photonics (2023). DOI: 10.1117/1.AP.5.1.015001 SPIE 제공
https://phys.org/news/2023-01-photonic-hopfions-particle.html
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메모 2301210633 나의 사고실험 oms 스토리텔링
나는 샘플링 omsful.origin을 보면서 부분적인 분포의 퍼짐을 생각해본곤 한다. 그런데 샘플링 qoms.overlapping.singularity의 어긋난 패턴들이 점멸하는 유기체적 banq를 연상한다.
우주에는 수많은 물질들이 분포돼 있다. 뭉치기도 하고 퍼짐을 가진다.이들이 skyrmion 입자처럼 행동하는(즉, 모양이 변하지 않는) 자성 박막의 자기장의 나노스케일 허리케인과 같은 질감을 가지기 한다. 이들은 가장 잘 표현할 수 있는 것이 샘플링 oss.base.banq이다. 허허.
샘플a.oms(standard)
b0acfd 0000e0
000ac0 f00bde
0c0fab 000e0d
e00d0c 0b0fa0
f000e0 b0dac0
d0f000 cae0b0
0b000f 0ead0c
0deb00 ac000f
ced0ba 00f000
a0b00e 0dc0f0
0ace00 df000b
0f00d0 e0bc0a
샘플b.qoms(standard)
0000000011=2,0
0000001100
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0000010010
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0101000000
0010010000
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2000000000
0010000001
샘플b.poms(standard)
q0000000000
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000q0000000
00000q00000
0000000q000
000000000q0
샘플c.oss(standard)
zxdxybzyz
zxdzxezxz
xxbyyxzzx
zybzzfxzy
cadccbcdc
cdbdcbdbb
xzezxdyyx
zxezybzyy
bddbcbdca
- In our daily lives, we can often find local wave structures that retain their shape as they spread. For example, imagine a smoke ring floating in the air. Similar stable structures have been studied in various research fields and can be found in magnets, nuclear systems and particle physics. In contrast to smoke rings, they can be made resilient to perturbations. This is known in mathematics and physics as phase protection.
-A typical example is the nanoscale hurricane-like texture of magnetic fields in magnetic thin films that behave like particles called skyrmions (i.e. do not change shape). A similar donut-shaped (or toroidal) pattern in 3D space that visualizes the complex spatial distribution of the various properties of a wave is called a hoppion. It is very difficult to achieve such structures with light waves. Recent studies of structured light reveal strong spatial variations in polarization, phase, and amplitude, opening opportunities to understand and design topologically stable optical structures that behave like particles. These quasiparticles of light, which control various topological properties, can have great potential as next-generation information carriers, for example for quantum technologies as well as ultra-large optical information transmission.
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memo 2301210633 my thought experiment oms storytelling
When looking at sampling omsful.origin, I often think of the spread of a partial distribution. However, the out-of-order patterns of sampling qoms.overlapping.singularity are reminiscent of flickering organic banq.
Numerous substances are distributed in the universe. It has both agglomeration and spreading. They have a nanoscale hurricane-like texture in the magnetic field of magnetic thin films that behave like skyrmion particles (i.e., do not change shape). The best representation of these is sampling oss.base.banq. haha.
Samplea.oms (standard)
b0acfd 0000e0
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sampleb.qoms (standard)
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000q0000000
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000000000q0
sample c.oss (standard)
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xxbyyxzzx
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zxezybzyy
bddbcbdca
Researchers develop new, more accurate computational tool for long-read RNA sequencing
연구자들은 장기 판독 RNA 시퀀싱을 위한 새롭고 더 정확한 계산 도구를 개발합니다
필라델피아 어린이 병원 크레딧: CC0 퍼블릭 도메인 JANUARY 20, 2023
-유전자에서 단백질로의 여정에서 초기 RNA 분자는 단백질로 번역되기 전에 다양한 방식으로 절단 및 결합 또는 접합될 수 있습니다. 대체 스플라이싱으로 알려진 이 과정을 통해 단일 유전자가 여러 다른 단백질을 인코딩할 수 있습니다. 대체 스플라이싱은 줄기 세포가 조직 특이적 세포로 성숙할 때와 같은 많은 생물학적 과정에서 발생합니다. 그러나 질병의 맥락에서 선택적 접합은 조절되지 않을 수 있습니다.
-따라서 상태의 근본 원인을 이해하기 위해서는 전사체(즉, 유전자에서 유래할 수 있는 모든 RNA 분자)를 검사하는 것이 중요합니다. 그러나 역사적으로 RNA 분자는 일반적으로 수천 염기 길이이기 때문에 전체를 "읽는" 것이 어려웠습니다. 대신 연구자들은 RNA 분자를 분해하여 플랫폼과 프로토콜에 따라 200~600개 정도의 훨씬 더 짧은 조각으로 배열하는 소위 short-read RNA 시퀀싱에 의존했습니다. 그런 다음 컴퓨터 프로그램을 사용하여 RNA 분자의 전체 서열을 재구성합니다. Short-read RNA 시퀀싱은 약 0.1%의 낮은 염기당 오류율로 매우 정확한 시퀀싱 데이터를 제공할 수 있습니다(시퀀싱된 1,000개의 염기마다 하나의 염기가 잘못 결정됨을 의미).
-그럼에도 불구하고 시퀀싱 읽기 길이가 짧기 때문에 제공할 수 있는 정보가 제한됩니다. 여러 면에서 short-read RNA sequencing은 큰 그림을 모양과 크기가 모두 같은 여러 조각으로 쪼갠 다음 그림을 다시 맞추려고 하는 것과 같습니다. 최근에는 길이가 10,000개가 넘는 RNA 분자를 끝에서 끝까지 시퀀싱할 수 있는 "장기 판독" 플랫폼이 출시되었습니다. 이러한 플랫폼은 시퀀싱되기 전에 RNA 분자를 분해할 필요가 없지만 일반적으로 5%에서 20% 사이의 훨씬 더 높은 염기당 오류율을 가지고 있습니다. 이 잘 알려진 제한은 long-read RNA 시퀀싱의 광범위한 채택을 심각하게 방해했습니다.
특히, 높은 오류율은 특정 조건이나 질병에서 발견된 이전에 알려지지 않은 새로운 RNA 분자의 유효성을 결정하기 어렵게 만들었습니다. 이 문제를 피하기 위해 CHOP(Children's Hospital of Philadelphia)의 연구원들은 이러한 오류가 발생하기 쉬운 장시간 판독 RNA 시퀀싱 데이터에서 RNA 분자를 보다 정확하게 발견하고 정량화할 수 있는 새로운 계산 도구를 개발했습니다.
ESPRESSO (Splice Site Options의 Error Statistics PRomoted Evaluator) 라는 도구 가 오늘 Science Advances 에 보고되었습니다 . "Long-read RNA 시퀀싱은 암과 같은 희귀 유전 질환 및 기타 조건에서 RNA 변이를 밝혀낼 수 있는 강력한 기술입니다."라고 CHOP의 전산 및 게놈 의학 센터 소장인 Yi Xing 박사는 말했습니다. 연구의 수석 저자. "우리는 아마도 RNA 분자를 발견하고 분석하는 방법에 있어 변곡점에 있을 것입니다. short-read에서 long-read RNA 시퀀싱으로의 전환은 흥미로운 기술 혁신을 나타내며, long-read RNA 시퀀싱 데이터를 안정적으로 해석하는 계산 도구가 시급히 필요합니다.
-" ESPRESSO는 오류가 발생하기 쉬운 long-read RNA 시퀀싱 데이터만 사용하여 동일한 유전자(RNA 이소형으로 알려진)에서 서로 다른 RNA 분자를 정확하게 발견하고 정량화할 수 있습니다. 이를 위해 계산 도구는 주어진 유전자의 모든 긴 RNA 시퀀싱 읽기를 해당 게놈 DNA와 비교한 다음 개별 긴 읽기의 오류 패턴을 사용하여 초기 RNA 분자가 절단되고 결합된 위치인 스플라이스 접합부를 자신 있게 식별합니다. — 뿐만 아니라 해당 전장 RNA 이소형. 긴 RNA 시퀀싱 읽기와 게놈 DNA 사이에 완벽하게 일치하는 영역을 찾고 유전자의 모든 긴 RNA 시퀀싱 읽기에서 정보를 차용함으로써 도구는 매우 신뢰할 수 있는 스플라이스 접합부 및 RNA 이소폼을 식별할 수 있습니다. 이전에 기존 데이터베이스에 문서화되었습니다.
연구원들은 시뮬레이션 데이터와 실제 생물학적 샘플 데이터를 사용하여 ESPRESSO의 성능을 평가했습니다. 그들은 ESPRESSO가 RNA 이소형을 발견하고 정량화하는 측면에서 현재 사용 가능한 여러 도구보다 더 나은 성능을 발휘한다는 것을 발견했습니다. 연구원들은 또한 30가지 인간 조직 유형과 3가지 인간 세포주를 포함하는 10억 개 이상의 긴 RNA 시퀀싱 판독을 생성 및 분석하여 전체 길이 RNA 동형체의 분해능에서 인간 전사체 변이를 연구하는 데 유용한 자원을 제공했습니다. "ESPRESSO는 장기 판독 RNA 시퀀싱의 오랜 문제를 해결하고 새로운 발견 기회를 안내할 수 있습니다."라고 Xing 박사는 말했습니다. "우리는 ESPRESSO가 연구자들이 다양한 생의학 및 임상 환경에서 세포의 RNA 레퍼토리를 탐색하는 데 유용한 도구가 될 것이라고 생각합니다."
추가 정보: Yuan Gao et al, ESPRESSO: 오류가 발생하기 쉬운 장기 판독 RNA-seq 데이터에서 전사 이소형의 강력한 발견 및 정량화, Science Advances (2023). DOI: 10.1126/sciadv.abq5072 . www.science.org/doi/10.1126/sciadv.abq5072 저널 정보: Science Advances 필라델피아 아동병원 제공
https://phys.org/news/2023-01-accurate-tool-long-read-rna-sequencing.html
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메모 2301210601 나의 사고실험 oms 스토리텔링
나의 샘플링 oss.base는 일종에 DNA 염기 서열과 같다. 조각 유전자일 수도 있고 인체의 총길이 30억개의 DNA 염기순서일 수도 있다. 이들이 샘플링 oms.banq로 키랄대칭의 전사체 RNA의 모습을 가질 수도 있다. 하지만 대부분은 대칭이 허용되지 않아 RNA 분자 전사체만 믿고 DNA를 만들면 심각한 오류를 만난다.
정교한 dna를 분석하려면 Long-read RNA 시퀀싱 샘플링 oss.base.dna에서 샘플링 qoms.banq 의 다양한 이중성.특이성을 이해해야 한다.
short-read RNA 시퀀싱은 조각들이 하나의 정상적인 DNA를 가지려는 경향도 point.oms 이나 line.oms 단위들이 모이여 선이나 입체의길이를 만들어지가 어려운 점을 해결하기도 하리라. 이는 먼지가 모이여 별을 탄생 시키는 문제처럼 보인다.
샘플a.oms(standard)
b0acfd 0000e0
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샘플b.qoms(standard)
0000000011=2,0
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샘플b.poms(standard)
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샘플c.oss(standard)
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-On the journey from gene to protein, nascent RNA molecules can be cut and joined or spliced in a variety of ways before being translated into proteins. This process, known as alternative splicing, allows a single gene to encode many different proteins. Alternative splicing occurs in many biological processes, such as when stem cells mature into tissue-specific cells. However, in the context of disease, alternative splicing may become dysregulated.
-Thus, it is important to examine the transcriptome (i.e., any RNA molecule that can originate from a gene) to understand the underlying cause of the condition. Historically, however, RNA molecules have been difficult to "read" in their entirety, as they are typically thousands of bases long. Instead, researchers have relied on so-called short-read RNA sequencing, in which RNA molecules are broken down and arranged into much shorter pieces of 200 to 600 pieces depending on the platform and protocol. A computer program is then used to reconstruct the entire sequence of the RNA molecule. Short-read RNA sequencing can provide highly accurate sequencing data with an error rate per base as low as approximately 0.1% (meaning one base is incorrectly determined for every 1,000 bases sequenced).
-Nevertheless, the short length of sequencing reads limits the information it can provide. In many ways, short-read RNA sequencing is like breaking a big picture into pieces that are all the same shape and size, and then trying to put the picture back together. Recently, "long-read" platforms have been introduced that allow for end-to-end sequencing of RNA molecules over 10,000 in length. These platforms do not require RNA molecules to be digested before being sequenced, but have much higher per-base error rates, typically between 5% and 20%. This well-known limitation has severely hampered the widespread adoption of long-read RNA sequencing.
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memo 2301210601 my thought experiment oms storytelling
My sampling oss.base is sort of like a DNA sequence. It could be a fragment of a gene or a sequence of 3 billion DNA bases in the total length of the human body. They may have the appearance of chirally symmetric transcript RNA with sampling oms.banq. However, symmetry is not allowed in most cases, so making DNA by relying only on RNA molecule transcripts is a serious error.
Sophisticated dna analysis requires an understanding of the various dualities.specificities of long-read RNA sequencing sampling oss.base.dna to sampling qoms.banq.
Short-read RNA sequencing will also solve the problem of the tendency of fragments to have a single normal DNA and the difficulty in making a line or three-dimensional length by combining point.oms or line.oms units. This seems like a matter of gathering dust to form stars.
Samplea.oms (standard)
b0acfd 0000e0
000ac0 f00bde
0c0fab 000e0d
e00d0c 0b0fa0
f000e0 b0dac0
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sample c.oss (standard)
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Photonic hopfions: 입자처럼 행동하는 연기 고리 모양의 빛 SPIE 에 의해 빛은 꼬인 연기 고리와 유사한 구조로 형성될 수 있습니다
크레딧: Y. Shen 및 Z. Zhu.
-우리는 일상 생활에서 퍼짐에 따라 모양을 유지하는 국부적인 파동 구조를 자주 발견할 수 있습니다. 예를 들어 연기 고리가 공중에 떠 있는 것을 상상해 보십시오. 유사한 안정 구조가 다양한 연구 분야에서 연구되었으며 자석, 핵 시스템 및 입자 물리학에서 찾을 수 있습니다. 연기의 고리와는 대조적으로 그들은 섭동에 탄력적으로 만들 수 있습니다. 이것은 수학 및 물리학에서 위상 보호로 알려져 있습니다.
-전형적인 예는 스커미온(skyrmion)이라 불리는 입자처럼 행동하는(즉, 모양이 변하지 않는) 자성 박막의 자기장의 나노스케일 허리케인과 같은 질감입니다. 파동의 다양한 특성의 복잡한 공간 분포를 시각화하는 3D 공간의 유사한 도넛 모양(또는 토로이달) 패턴을 홉피온이라고 합니다. 광파 로 이러한 구조를 달성 하는 것은 매우 어렵습니다. 구조광에 대한 최근의 연구는 편광, 위상 및 진폭의 강력한 공간적 변화를 보여 입자처럼 거동하는 위상적으로 안정적인 광학 구조를 이해하고 설계할 수 있는 기회를 열어줍니다. 다양한 토폴로지 특성을 제어하는 이러한 빛의 준입자는 예를 들어 양자 기술뿐만 아니라 초대형 광 정보 전송을 위한 차세대 정보 캐리어로서 큰 잠재력을 가질 수 있습니다.
Advanced Photonics 에 보고된 바와 같이 , 영국과 중국의 협력 물리학자들은 최근 3차원에서 위상적으로 안정적인 특성을 설계한 편광 패턴의 생성을 시연했으며, 처음으로 자유 공간에서 제어 가능하게 변형되고 전파될 수 있습니다. (a) 스핀을 작동 조작-공간 구: 작동 조작 2구의 수직 및 위도 각도(α 및 β)는 건축 색상과 낮(스핀이 아래로 향하는 남극 계단 상태 및 완전음)으로 표시됩니다. 스핀이 윗인 노스게이트). 파라메트릭 2구의 각막 점은 3D 유클리드 공간에 펼쳐진 트윈 iso-spin 선에 해당합니다. (b) 하이퍼스피어의 수직 위도 β 및 다른 직각 α의 선택된 점에서 깎인 선(해당 건축자재 색상이 있는 점 점으로 강조표시됨)은 토러스를 덮는 토러스 생산을 형성합니다(다른 β에 해당하는 다른 토러스 포함) ). . (c) 하이퍼스피어로부터의 전체 벽체 상황의 Hopf 피브레이션의 실제 공간은 동축으로 그려진 토리 세트에 매달린 토러스 표시, 각 토러스는 플로어메트릭 2구의 서로 다른 위도 β에 해당합니다.
검은색 원은 (a)에서 남극(스핀 다운)에 해당하고 나타난 토리의 축은 남북(스핀 업)에 해당합니다. (d) 인서트에 연장대로 (a)에서 파라메트릭 구의 α 및 β-엽으로 색이 표준 스핀 벡터와 함께 (c)의 아이소스핀에 해당하는 홉피온의 3D 스핀각 수축. (e, f) (d)의 스핀 조작 법원: (e) xy(z = 0) 및 (f) yz(x = 0) 외관은 회색 화살표가 있는 스커미온 구조 유사를 보여줍니다. skyrmions의 소용돌이를 표시합니다. 색상 물리적은 (d)의 스핀 방향에 해당하는 것과 동일합니다.크레딧: Shen et al., doi 10.1117/1.AP.5.1.015001 검은색 원은 (a)에서 남극(스핀 다운)에 해당하고 중첩된 토리의 축은 북극(스핀 업)에 해당합니다. (d) 인서트에 표시된 대로 (a)에서 파라메트릭 구의 α 및 β 매개변수로 색상이 지정된 각 스핀 벡터와 함께 (c)의 아이소스핀 윤곽에 해당하는 홉피온의 3D 스핀 분포. (e, f) (d)의 스핀 분포 단면도: (e) xy(z = 0) 및 (f) yz(x = 0) 단면은 회색 화살표가 있는 스커미온 유사 구조를 보여줍니다. skyrmions의 소용돌이를 표시합니다. 컬러 스케일은 (d)의 스핀 방향에 해당하는 것과 동일합니다. 크레딧: Shen et al., doi 10.1117/1.AP.5.1.015001 검은색 원은 (a)에서 남극(스핀 다운)에 해당하고 중첩된 토리의 축은 북극(스핀 업)에 해당합니다. (d) 인서트에 표시된 대로 (a)에서 파라메트릭 구의 α 및 β 매개변수로 색상이 지정된 각 스핀 벡터와 함께 (c)의 아이소스핀 윤곽에 해당하는 홉피온의 3D 스핀 분포. (e, f) (d)의 스핀 분포 단면도: (e) xy(z = 0) 및 (f) yz(x = 0) 단면은 회색 화살표가 있는 스커미온 유사 구조를 보여줍니다. skyrmions의 소용돌이를 표시합니다. 컬러 스케일은 (d)의 스핀 방향에 해당하는 것과 동일합니다. 크레딧: Shen et al., doi 10.1117/1.AP.5.1.015001 인서트에 표시된 것처럼 (a)의 파라메트릭 구의 α 및 β 매개변수로 색상이 지정된 각 스핀 벡터를 사용하여 (c)의 아이소스핀 윤곽에 해당합니다. (e, f) (d)의 스핀 분포 단면도: (e) xy(z = 0) 및 (f) yz(x = 0) 단면은 회색 화살표가 있는 스커미온 유사 구조를 보여줍니다. skyrmions의 소용돌이를 표시합니다. 컬러 스케일은 (d)의 스핀 방향에 해당하는 것과 동일합니다. 크레딧: Shen et al., doi 10.1117/1.AP.5.1.015001 인서트에 표시된 것처럼 (a)의 파라메트릭 구의 α 및 β 매개변수로 색상이 지정된 각 스핀 벡터를 사용하여 (c)의 아이소스핀 윤곽에 해당합니다. (e, f) (d)의 스핀 분포 단면도: (e) xy(z = 0) 및 (f) yz(x = 0) 단면은 회색 화살표가 있는 스커미온 유사 구조를 보여줍니다. skyrmions의 소용돌이를 표시합니다. 컬러 스케일은 (d)의 스핀 방향에 해당하는 것과 동일합니다. 크레딧: Shen et al., doi 10.1117/1.AP.5.1.015001 컬러 스케일은 (d)의 스핀 방향에 해당하는 것과 동일합니다. 크레딧: Shen et al., doi 10.1117/1.AP.5.1.015001 컬러 스케일은 (d)의 스핀 방향에 해당하는 것과 동일합니다. 크레딧: Shen et al., doi 10.1117/1.AP.5.1.015001
-이러한 중대한 결과로 몇 가지 중요한 발전과 새로운 관점이 제공됩니다. "우리는 전기와 심판 숫자가 풀리고 기준으로 조정될 수 있는 3D 재활성 솔리톤의 새롭고 매우 생생한 구조화된 조명 제품군을 보고합니다. 이 논문의 주저자인 영국 사우샘프턴 대학교의 Yijie Shen은 말합니다. "우리의 결과는 광 구조의 엄청난 아름다움을 보여줍니다. 광통신, 양자 기술, 광 물질 상호 작용, 초고해상도 현미경 및 계측에서 위상 보호 광 구성의 잠재적 응용에 대한 추가 조사에 영감을 주기를 바랍니다."라고 교수인 Anatoly Zayats는 말합니다. King's College London에서 프로젝트를 이끌고 있습니다. 이 작업은 이 홉피온의 작업과 적 생성 및 권리화를 설명하는 작업자 배경을 제공하여 기술적으로 보호되는 탱크 작업자의 인력 구조를 보여줍니다. 표준물질에 축소된 홉피온의 이전 관찰과 작업, 이 작업은 반직관적으로 광학 홉피온 이 전기통의 축소 된 보호를 통해 자유 공간에서 끌어낼 수 있음을 보여줍니다. 프록시된 광자 홉피온의 수요자 토폴로지는 종종 응용 분야에서 열립니다. 이 새로 개발된 광학 위상 홉피온 모델은 물리학의 다른 분야에서 다른 고차 위상 구조로 쉽게 확장될 수 있습니다. 고차 홉피온은 고에너지 물리학에서 자성 물질에 이르기까지 다른 물리학 커뮤니티에서 관찰하기에는 여전히 큰 도전입니다. 이 작업에서 제안된 광학적 접근 방식은 다른 물리학 분야의 복잡한 구조 분야에 대한 더 깊은 이해를 제공할 수 있습니다.
추가 정보: Yijie Shen 외, 광자 홉피온의 위상 변환 및 자유 공간 전송, Advanced Photonics (2023). DOI: 10.1117/1.AP.5.1.015001 SPIE 제공
https://phys.org/news/2023-01-photonic-hopfions-particle.html
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메모 2301210633 나의 사고실험 oms 스토리텔링
나는 샘플링 omsful.origin을 보면서 부분적인 분포의 퍼짐을 생각해본곤 한다. 그런데 샘플링 qoms.overlapping.singularity의 어긋난 패턴들이 점멸하는 유기체적 banq를 연상한다.
우주에는 수많은 물질들이 분포돼 있다. 뭉치기도 하고 퍼짐을 가진다.이들이 skyrmion 입자처럼 행동하는(즉, 모양이 변하지 않는) 자성 박막의 자기장의 나노스케일 허리케인과 같은 질감을 가지기 한다. 이들은 가장 잘 표현할 수 있는 것이 샘플링 oss.base.banq이다. 허허.
샘플a.oms(standard)
b0acfd 0000e0
000ac0 f00bde
0c0fab 000e0d
e00d0c 0b0fa0
f000e0 b0dac0
d0f000 cae0b0
0b000f 0ead0c
0deb00 ac000f
ced0ba 00f000
a0b00e 0dc0f0
0ace00 df000b
0f00d0 e0bc0a
샘플b.qoms(standard)
0000000011=2,0
0000001100
0000001100
0000010010
0001100000
0101000000
0010010000
0100100000
2000000000
0010000001
샘플b.poms(standard)
q0000000000
00q00000000
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0q000000000
000q0000000
00000q00000
0000000q000
000000000q0
샘플c.oss(standard)
zxdxybzyz
zxdzxezxz
xxbyyxzzx
zybzzfxzy
cadccbcdc
cdbdcbdbb
xzezxdyyx
zxezybzyy
bddbcbdca
- In our daily lives, we can often find local wave structures that retain their shape as they spread. For example, imagine a smoke ring floating in the air. Similar stable structures have been studied in various research fields and can be found in magnets, nuclear systems and particle physics. In contrast to smoke rings, they can be made resilient to perturbations. This is known in mathematics and physics as phase protection.
-A typical example is the nanoscale hurricane-like texture of magnetic fields in magnetic thin films that behave like particles called skyrmions (i.e. do not change shape). A similar donut-shaped (or toroidal) pattern in 3D space that visualizes the complex spatial distribution of the various properties of a wave is called a hoppion. It is very difficult to achieve such structures with light waves. Recent studies of structured light reveal strong spatial variations in polarization, phase, and amplitude, opening opportunities to understand and design topologically stable optical structures that behave like particles. These quasiparticles of light, which control various topological properties, can have great potential as next-generation information carriers, for example for quantum technologies as well as ultra-large optical information transmission.
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memo 2301210633 my thought experiment oms storytelling
When looking at sampling omsful.origin, I often think of the spread of a partial distribution. However, the out-of-order patterns of sampling qoms.overlapping.singularity are reminiscent of flickering organic banq.
Numerous substances are distributed in the universe. It has both agglomeration and spreading. They have a nanoscale hurricane-like texture in the magnetic field of magnetic thin films that behave like skyrmion particles (i.e., do not change shape). The best representation of these is sampling oss.base.banq. haha.
Samplea.oms (standard)
b0acfd 0000e0
000ac0 f00bde
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e00d0c 0b0fa0
f000e0 b0dac0
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sampleb.qoms (standard)
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sample b.poms (standard)
q0000000000
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000q0000000
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sample c.oss (standard)
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xxbyyxzzx
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cadccbcdc
cdbdcbdbb
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zxezybzyy
bddbcbdca
Researchers develop new, more accurate computational tool for long-read RNA sequencing
연구자들은 장기 판독 RNA 시퀀싱을 위한 새롭고 더 정확한 계산 도구를 개발합니다
필라델피아 어린이 병원 크레딧: CC0 퍼블릭 도메인 JANUARY 20, 2023
-유전자에서 단백질로의 여정에서 초기 RNA 분자는 단백질로 번역되기 전에 다양한 방식으로 절단 및 결합 또는 접합될 수 있습니다. 대체 스플라이싱으로 알려진 이 과정을 통해 단일 유전자가 여러 다른 단백질을 인코딩할 수 있습니다. 대체 스플라이싱은 줄기 세포가 조직 특이적 세포로 성숙할 때와 같은 많은 생물학적 과정에서 발생합니다. 그러나 질병의 맥락에서 선택적 접합은 조절되지 않을 수 있습니다.
-따라서 상태의 근본 원인을 이해하기 위해서는 전사체(즉, 유전자에서 유래할 수 있는 모든 RNA 분자)를 검사하는 것이 중요합니다. 그러나 역사적으로 RNA 분자는 일반적으로 수천 염기 길이이기 때문에 전체를 "읽는" 것이 어려웠습니다. 대신 연구자들은 RNA 분자를 분해하여 플랫폼과 프로토콜에 따라 200~600개 정도의 훨씬 더 짧은 조각으로 배열하는 소위 short-read RNA 시퀀싱에 의존했습니다. 그런 다음 컴퓨터 프로그램을 사용하여 RNA 분자의 전체 서열을 재구성합니다. Short-read RNA 시퀀싱은 약 0.1%의 낮은 염기당 오류율로 매우 정확한 시퀀싱 데이터를 제공할 수 있습니다(시퀀싱된 1,000개의 염기마다 하나의 염기가 잘못 결정됨을 의미).
-그럼에도 불구하고 시퀀싱 읽기 길이가 짧기 때문에 제공할 수 있는 정보가 제한됩니다. 여러 면에서 short-read RNA sequencing은 큰 그림을 모양과 크기가 모두 같은 여러 조각으로 쪼갠 다음 그림을 다시 맞추려고 하는 것과 같습니다. 최근에는 길이가 10,000개가 넘는 RNA 분자를 끝에서 끝까지 시퀀싱할 수 있는 "장기 판독" 플랫폼이 출시되었습니다. 이러한 플랫폼은 시퀀싱되기 전에 RNA 분자를 분해할 필요가 없지만 일반적으로 5%에서 20% 사이의 훨씬 더 높은 염기당 오류율을 가지고 있습니다. 이 잘 알려진 제한은 long-read RNA 시퀀싱의 광범위한 채택을 심각하게 방해했습니다.
특히, 높은 오류율은 특정 조건이나 질병에서 발견된 이전에 알려지지 않은 새로운 RNA 분자의 유효성을 결정하기 어렵게 만들었습니다. 이 문제를 피하기 위해 CHOP(Children's Hospital of Philadelphia)의 연구원들은 이러한 오류가 발생하기 쉬운 장시간 판독 RNA 시퀀싱 데이터에서 RNA 분자를 보다 정확하게 발견하고 정량화할 수 있는 새로운 계산 도구를 개발했습니다.
ESPRESSO (Splice Site Options의 Error Statistics PRomoted Evaluator) 라는 도구 가 오늘 Science Advances 에 보고되었습니다 . "Long-read RNA 시퀀싱은 암과 같은 희귀 유전 질환 및 기타 조건에서 RNA 변이를 밝혀낼 수 있는 강력한 기술입니다."라고 CHOP의 전산 및 게놈 의학 센터 소장인 Yi Xing 박사는 말했습니다. 연구의 수석 저자. "우리는 아마도 RNA 분자를 발견하고 분석하는 방법에 있어 변곡점에 있을 것입니다. short-read에서 long-read RNA 시퀀싱으로의 전환은 흥미로운 기술 혁신을 나타내며, long-read RNA 시퀀싱 데이터를 안정적으로 해석하는 계산 도구가 시급히 필요합니다.
-" ESPRESSO는 오류가 발생하기 쉬운 long-read RNA 시퀀싱 데이터만 사용하여 동일한 유전자(RNA 이소형으로 알려진)에서 서로 다른 RNA 분자를 정확하게 발견하고 정량화할 수 있습니다. 이를 위해 계산 도구는 주어진 유전자의 모든 긴 RNA 시퀀싱 읽기를 해당 게놈 DNA와 비교한 다음 개별 긴 읽기의 오류 패턴을 사용하여 초기 RNA 분자가 절단되고 결합된 위치인 스플라이스 접합부를 자신 있게 식별합니다. — 뿐만 아니라 해당 전장 RNA 이소형. 긴 RNA 시퀀싱 읽기와 게놈 DNA 사이에 완벽하게 일치하는 영역을 찾고 유전자의 모든 긴 RNA 시퀀싱 읽기에서 정보를 차용함으로써 도구는 매우 신뢰할 수 있는 스플라이스 접합부 및 RNA 이소폼을 식별할 수 있습니다. 이전에 기존 데이터베이스에 문서화되었습니다.
연구원들은 시뮬레이션 데이터와 실제 생물학적 샘플 데이터를 사용하여 ESPRESSO의 성능을 평가했습니다. 그들은 ESPRESSO가 RNA 이소형을 발견하고 정량화하는 측면에서 현재 사용 가능한 여러 도구보다 더 나은 성능을 발휘한다는 것을 발견했습니다. 연구원들은 또한 30가지 인간 조직 유형과 3가지 인간 세포주를 포함하는 10억 개 이상의 긴 RNA 시퀀싱 판독을 생성 및 분석하여 전체 길이 RNA 동형체의 분해능에서 인간 전사체 변이를 연구하는 데 유용한 자원을 제공했습니다. "ESPRESSO는 장기 판독 RNA 시퀀싱의 오랜 문제를 해결하고 새로운 발견 기회를 안내할 수 있습니다."라고 Xing 박사는 말했습니다. "우리는 ESPRESSO가 연구자들이 다양한 생의학 및 임상 환경에서 세포의 RNA 레퍼토리를 탐색하는 데 유용한 도구가 될 것이라고 생각합니다."
추가 정보: Yuan Gao et al, ESPRESSO: 오류가 발생하기 쉬운 장기 판독 RNA-seq 데이터에서 전사 이소형의 강력한 발견 및 정량화, Science Advances (2023). DOI: 10.1126/sciadv.abq5072 . www.science.org/doi/10.1126/sciadv.abq5072 저널 정보: Science Advances 필라델피아 아동병원 제공
https://phys.org/news/2023-01-accurate-tool-long-read-rna-sequencing.html
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메모 2301210601 나의 사고실험 oms 스토리텔링
나의 샘플링 oss.base는 일종에 DNA 염기 서열과 같다. 조각 유전자일 수도 있고 인체의 총길이 30억개의 DNA 염기순서일 수도 있다. 이들이 샘플링 oms.banq로 키랄대칭의 전사체 RNA의 모습을 가질 수도 있다. 하지만 대부분은 대칭이 허용되지 않아 RNA 분자 전사체만 믿고 DNA를 만들면 심각한 오류를 만난다.
정교한 dna를 분석하려면 Long-read RNA 시퀀싱 샘플링 oss.base.dna에서 샘플링 qoms.banq 의 다양한 이중성.특이성을 이해해야 한다.
short-read RNA 시퀀싱은 조각들이 하나의 정상적인 DNA를 가지려는 경향도 point.oms 이나 line.oms 단위들이 모이여 선이나 입체의길이를 만들어지가 어려운 점을 해결하기도 하리라. 이는 먼지가 모이여 별을 탄생 시키는 문제처럼 보인다.
샘플a.oms(standard)
b0acfd 0000e0
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ced0ba 00f000
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0f00d0 e0bc0a
샘플b.qoms(standard)
0000000011=2,0
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샘플b.poms(standard)
q0000000000
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샘플c.oss(standard)
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-On the journey from gene to protein, nascent RNA molecules can be cut and joined or spliced in a variety of ways before being translated into proteins. This process, known as alternative splicing, allows a single gene to encode many different proteins. Alternative splicing occurs in many biological processes, such as when stem cells mature into tissue-specific cells. However, in the context of disease, alternative splicing may become dysregulated.
-Thus, it is important to examine the transcriptome (i.e., any RNA molecule that can originate from a gene) to understand the underlying cause of the condition. Historically, however, RNA molecules have been difficult to "read" in their entirety, as they are typically thousands of bases long. Instead, researchers have relied on so-called short-read RNA sequencing, in which RNA molecules are broken down and arranged into much shorter pieces of 200 to 600 pieces depending on the platform and protocol. A computer program is then used to reconstruct the entire sequence of the RNA molecule. Short-read RNA sequencing can provide highly accurate sequencing data with an error rate per base as low as approximately 0.1% (meaning one base is incorrectly determined for every 1,000 bases sequenced).
-Nevertheless, the short length of sequencing reads limits the information it can provide. In many ways, short-read RNA sequencing is like breaking a big picture into pieces that are all the same shape and size, and then trying to put the picture back together. Recently, "long-read" platforms have been introduced that allow for end-to-end sequencing of RNA molecules over 10,000 in length. These platforms do not require RNA molecules to be digested before being sequenced, but have much higher per-base error rates, typically between 5% and 20%. This well-known limitation has severely hampered the widespread adoption of long-read RNA sequencing.
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memo 2301210601 my thought experiment oms storytelling
My sampling oss.base is sort of like a DNA sequence. It could be a fragment of a gene or a sequence of 3 billion DNA bases in the total length of the human body. They may have the appearance of chirally symmetric transcript RNA with sampling oms.banq. However, symmetry is not allowed in most cases, so making DNA by relying only on RNA molecule transcripts is a serious error.
Sophisticated dna analysis requires an understanding of the various dualities.specificities of long-read RNA sequencing sampling oss.base.dna to sampling qoms.banq.
Short-read RNA sequencing will also solve the problem of the tendency of fragments to have a single normal DNA and the difficulty in making a line or three-dimensional length by combining point.oms or line.oms units. This seems like a matter of gathering dust to form stars.
Samplea.oms (standard)
b0acfd 0000e0
000ac0 f00bde
0c0fab 000e0d
e00d0c 0b0fa0
f000e0 b0dac0
d0f000 cae0b0
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sampleb.qoms (standard)
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sample b.poms (standard)
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sample c.oss (standard)
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bddbcbdca
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