KITE 코드는 새로운 양자 개발에 힘을 실어 줄 수있다

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.KITE 코드는 새로운 양자 개발에 힘을 실어 줄 수있다

에 의해 뉴욕의 대학 크레딧 : CC0 Public Domain 2020 년 3 월 2 일

University of York의 물리학과가 이끄는 연구 협력은 세계 컴퓨팅 능력을 크게 향상시킬 수있는 양자 재료의 생성을 지원하는 오픈 소스 소프트웨어를 만들었습니다. 전 세계에 걸쳐 데이터 센터와 클라우드 컴퓨팅의 사용이 증가함에 따라 많은 양의 에너지가 소비되고 있습니다. 양자 재료가이 문제를 해결하는 데 도움이 될 수 있다고 연구원들은 말합니다. 전자의 집단 행동으로 인해 발생하는 비 전통적인 양자 효과를 이용하는 물질 인 양자 물질은 완전한 태양 광 스펙트럼에서 에너지를 수확하거나 열 손실이 적은 방대한 양의 데이터를 처리하는 등 이전에는 불가능하다고 생각했던 작업을 수행 할 수있었습니다. 강렬한 컴퓨팅 성능을 제공 할 수있는 양자 재료의 설계는 전류와 광 신호로 '여진'될 때 재료가 어떻게 동작하는지 예측할 수있는 정교한 컴퓨터 프로그램에 의해 안내됩니다. 계산 모델링은 브라질, EU, 요크 대학의 연구원들이 개발 한 오픈 소스 컴퓨터 코드 인 Quantum KITE 이니셔티브 발표로 ' 양자 도약 '을 앞당겼습니다. KITE는 전례없는 수의 원자로 실제 재료를 시뮬레이션 할 수 있으므로 다양한 에너지 및 컴퓨팅 응용 분야에 적합한 양자 재료 를 생성하고 최적화하는 데 이상적 입니다. 요크 대학교 (University of York)의 연구 그룹을 이끄는 왕립 학회 (Royal Society University) 연구 연구원이자 물리학 부교수 인 아이레스 페레이라 박사 (Dr. Aires Ferreira)는 다음과 같이 말했습니다. "우리의 접근 방식은 새로운 종류의 양자 시뮬레이션 알고리즘을 사용하여 태양 전지 에서 저전력 트랜지스터에 이르는 광범위한 응용 분야의 재료 특성을 예측하고 조정하는 데 도움을줍니다 . "무료 오픈 소스 KITE 코드의 첫 번째 버전은 이미 전자 구조 및 재료에 대한 장치 레벨 시뮬레이션에서 매우 고무적인 기능을 보여줍니다. "수십억 개의 원자 궤도를 처리 할 수있는 KITE의 능력은 양자 과학의 어느 분야에서도 전례가없는 것으로, 응축 물질 물리학 및 재료의 계산 모델링에서 새로운 경계를 열 수있는 잠재력을 가지고 있습니다." KITE의 주요 측면 중 하나는 다양한 종류의 불균일성과 불완전 성을 통해 사실적인 재료를 시뮬레이션 할 수있는 유연성입니다. 브라질 리우데 자네이루 연방 대학교의 Tatiana Rappoport 박사는 다음과 같이 말했습니다. "이 오픈 소스 소프트웨어 는 현실적인 양자 시뮬레이션에 대한 장벽을 제거하고 개방 과학 문화를 장려하기위한 우리의 노력입니다. 우리의 코드에는 원자의주기적인 배열 내에서의 불완전 성을 시뮬레이션하는 '장애 세포'접근법과 다른 과학계와 산업계에 유용한 RAM 집약적 계산을 다루고 있습니다. " Royal Society Open Science 의 연구 논문을 읽으십시오 .

더 탐색 양자 시뮬레이터에서 분자와 물질을 연구하는 새로운 기술 발견 추가 정보 : Simão M. João et al. KITE : 로열 소사이어티 오픈 사이언스 ( Royal Society Open Science) (2020) : 대형 분자, 무질서한 결정 및 이종 구조의 전자 구조 및 응답 기능의 고성능 정확한 모델링 . DOI : 10.1098 / rsos.191809 저널 정보 : Royal Society Open Science 에서 제공하는 뉴욕의 대학

https://phys.org/news/2020-03-kite-code-power-quantum.html

 

 

.초파리의 장을 들여다 보면 무엇을 배울 수 있습니까? 많이 나옵니다!

에 의해 과학 카네기 연구소 Bellymount를 통해 연구자들은 과일 파리 내장 및 기타 내장 기관의 살아있는 조직을 실시간으로 들여다 볼 수 있습니다. 생물 과학 분야에서 혁신적인 대량의 시계열 영상 데이터를 연구원에게 제공합니다. 크레딧 : Leslie Koyama와 Lucy O'Brien.2020 년 3 월 2 일

그들은 그림의 가치가 1,000 단어라고 말합니다. 그러나 위장 시스템의 복잡성에 대한 실시간 창은 어떻습니까? 생물 학자들은 새로운 연구 도구를 사용하여 장 조직을 건강 하게 유지하는 세포 재생 과정 과 미생물 군집을 구성하는 박테리아 종 간의 상호 작용 을 실시간으로 관찰 할 수있었습니다 . Stanford University의 Lucy O'Brien과 KC Huang과 Carnegie의 Will Ludington이 이끄는 그들의 작품은 최근 PLOS Biology에 의해 출판되었습니다 . Bellymount라고 불리는이 시스템은 연구자들이 초파리의 살아있는 조직을 들여다보고 거기에서 발생하는 많은 복잡하고 겹치는 과정을 더 잘 이해할 수있게 해주었다. 오브라이언은 위장 시스템의 줄기 세포가 아픈 세포를 제거하고 새롭고 건강한 세포로 대체하는 조직 재생 과정을 어떻게 추진하는지 이해하기 위해 개발했습니다. 이 프로세스가 중단되면 노화 효과가 있습니다. 그것을 이해하면 정밀 의학의 개선을 이끌고 재생 요법의 개발을 이끌 수 있습니다. 오브라이언은“지금까지 장 갱신이 며칠에 걸쳐 발생하고 신체 내부에서 깊어지기 때문에 장의 재생이 어떻게 진행되는지 지켜 보는 사람은 아무도 없다”고 설명했다. 연구팀은 Bellymount를 사용하여 장기 재생 과정에서 줄기 세포가 코디네이 팅되는 것을 관찰 할 수 있었고 개별 줄기 세포가 성체 대체 세포를 생성하는 속도 가 크게 다르다는 것을 발견했습니다 . 이 직전에 장의 재생 과정이 실시간으로 진행되는 것을 본 사람은 없습니다. 스탠포드의 수석 저자 인 레슬리 코야마 (Leslie Koyama)는“각 줄기 세포는 각자의 속도로 작동하는 것 같다”고 말했다. 배를 넘어 벨리 마운트는 연구자들이 초파리에서 다른 내장 장기를 감시하여 전신 과정에서 장기가 서로 통신하는 방식을 관찰 할 수있게한다. 또한 미생물 군집에서 종 간의 상호 작용을 이해하는 것을 전문으로하는 Ludington은 장내 세균이 전개되는 것을 관찰하여 장내 세균이 많은 기능에 어떻게 기여하는지 더 잘 이해할 수있게 해주었다. "Bellymount는 장내 박테리아 집단과 숙주의 역동적 인 상호 작용을 처음으로 관찰 할 수있게 해주었다"고 말했다. 그들은 실제로 줄기 세포 활동의 지역성을 모방하는 마이크로 바이 옴 안정성에 지역적 차이가 있음을 발견했습니다. 마이크로 바이 옴의 일부는 지속적으로 뒤집히고 나머지는 저수지와 비슷합니다. 스탠포드의 공동 저자 인 KC Huang은 " 장 줄기 세포 와 장내 세균이 서로 어떻게 대화하고 그들의 행동을 조정하고 있는지 궁금해한다 "고 말했다. "이제 우리는 실제로 대화를 도청 할 힘이 있습니다." 벨리 마운트는 연구자들이 모든 파리 내장 장기의 활동을 엿볼 수있게 해주므로,이 누화는 조직 전체에서 모니터링 될 수 있으며 면역 감시, 생식, 노화 및 암과 같은 전신 과정을 이해하는 방법을 알 수 있습니다.

더 탐색 면역 체계와 장내 세균의 상호 작용 매핑 더 많은 정보 : Leslie Ann Jaramillo Koyama et al., Bellymount는 성인 Drosophila, PLOS Biology (2020) 에서 복부 장기 및 장내 미생물의 종 방향, 유리 체내 영상을 가능하게 합니다. DOI : 10.1371 / journal.pbio.3000567 저널 정보 : PLoS Biology 과학을위한 카네기 연구소 제공

https://phys.org/news/2020-03-peering-fruit-gut-lot.html

 

 

.생물 학자들은 조절 단백질과 그들의 게놈 전체 표적 사이의 맹목적인 상호 작용을 포착합니다

에 의해 뉴욕 대학 크레딧 : CC0 Public Domain 2020 년 3 월 2 일

뉴욕 대학교 생물 학자들은 유전자 발현을 제어하는 ​​단백질 인 전사 인자와 게놈의 유전자를 표적으로하는 사이의 매우 일시적인 상호 작용을 포착했으며, 일반적으로 놓친 상호 작용은 중요한 실질적인 영향을 가지고 있음을 보여주었습니다. Nature Communications에 발표 된 새로운 연구에서 , 연구원들은 식물에서 질소 사용에 관여하는 주된 전사 인자 인 NLP7의 일시적인 상호 작용을 포착하는 방법을 개발하여 질소에 대한 식물의 반응의 대부분이 이러한 단기적 규제에 의해 제어됨을 밝혔다 상호 작용. NYU 생물학과의 Carroll & Milton Petrie 교수 글로리아 코 루지 (Gloria Coruzzi)는“ 전역 전사 인자-표적 상호 작용을 게놈 전체 에 포획하는 우리의 접근법 은 농업이나 의학에 관심있는 모든 경로에 대한 전사 인자 의 동적 인 상호 작용을 검증하기 위해 적용될 수있다. 유전체학 및 시스템 생물학 센터 및 논문의 수석 저자. 조절 단백질과 DNA 사이의 동적 상호 작용은 변화하는 세포 또는 외부 환경에 반응하여 RNA로 유전자의 제어 된 발현을 유발하는데 중요하다. 그러나, 현재의 생화학 적 방법은 전사 인자와 그의 DNA 표적 사이의 안정한 (이탈하지 않는) 상호 작용을 필요로하므로, 전사 인자와 이들의 게놈-전체 표적 사이의 근본적인 일시적인 상호 작용은 크게 누락되었다. 에서 자연 커뮤니케이션 연구, 연구자들은 NLP7, 질소 흡수에 관여하는 유전자 조절 식물의 마스터 전사 인자 사이의 이러한 어려운 과도 상호 작용 목격 식물의 성장을 , 그 표적 유전자를 . 질소는 식물 개발에 중요한 영양소이며 토양과 비료에서 발견됩니다. 연구진은 NLP7 핵 수입 후 수분 내에 수행 된 생화학 적 검출 방법에 의해 포획되지 않은 게놈 전체 표적과 NLP7의 매우 일시적인 상호 작용을 포착했다. 그들은 NLP7을 박테리아의 DNA 메틸화 효소에 융합시켜 식물 세포의 핵으로 들어가도록 유도했습니다. 언제든지 NLP7은 유전자를 만졌을 때조차 짧게 DNA에 영구적 인 메틸화 마크를 남길 것입니다. 그들은 또한 NLP7과 게놈에서 이의 표적 유전자 사이의 이러한 매우 일시적인 상호 작용이 유전자를 RNA로 새롭고 지속적으로 전사시키는 것을 보여 주었다. "우리는 전체 식물에서 NLP7에 의해 조절되는 유전자의 50 % 이상이 분리 된 식물 세포에서 포획 된 제어 된 NLP7 핵 수입의 5 분 내에 발생하는 매우 일시적인 전사 인자 -DNA 상호 작용을 포함한다는 것을 발견했다. 또한, 일시적인 NLP7 결합은 전사를 활성화시킨다 전체 식물 뿌리에서 질소 반응성 유전자 의 50 % 이상을 조절하는 캐스케이드 "라고 Coruzzi는 설명했다. 식물에서 질소에 대한 유전자 반응의 절반 이상이 NLP7과의 일시적인 상호 작용에 의해 제어된다는 점을 감안할 때, 연구자들은 NLP7의 이러한 게놈 전체 목표가 발견되면 질소 사용 효율을 개선하는 데 영향을 미쳐 농업과 지속 가능성에 도움이 될 수 있다고 지적했다.

더 탐색 과학자들은 유전자 조절 네트워크를 검증하는 방법을 개발 추가 정보 : José M. Alvarez et al., 마스터 전사 인자 NLP7의 일시적인 게놈 전체 상호 작용은 빠른 질소-반응 캐스케이드 인 Nature Communications (2020)를 시작합니다. DOI : 10.1038 / s41467-020-14979-6 저널 정보 : Nature Communications 에서 제공하는 뉴욕 대학

https://phys.org/news/2020-03-biologists-capture-fleeting-interactions-regulatory.html

 

 

.기술은 단일 분자를 조사하는 새로운 방법을 제공합니다

노스 웨스턴 대학교 메간 펠먼 상업적으로 이용 가능한 Orbitrap 분석기를 중심으로 회전하는 단백질 또는 바이러스 유사 입자의 단일 분자가 정확한 질량을 결정합니다. 크레딧 : Northwestern University 2020 년 3 월 2 일

생물학은 어둡고 의학은 매우 복잡한 분자 혼합물을 다루는 것을 포함합니다. 노스 웨스턴 대학 (Northwestern University)에서 개발 된 새로운 기술은 이제 과학자들에게 원자까지 단백질을 정밀하게 측정하여 명확성을 제공합니다. 개별 이온 질량 분광법 또는 I2MS 라고하는 강력하고 새로운 접근 방식 은 광범위한 온전한 단백질의 정확한 질량을 결정할 수 있습니다. 그것은 각각의 분자마다 개별적으로 무게를 weigh니다. 이 능력은 질병과 감염에 대한 이해를 돕고 코로나 바이러스 와 같은 치명적인 바이러스에 대한 백신 설계를 가속화합니다 . 단백질의 단일 분자 또는 전체 바이러스와 같은 어셈블리의 무게를 측정하는 근본적으로 새로운 방법에 대한 자세한 내용은 Nature Methods 저널에 의해 3 월 2 일에 출판되었습니다 . 연구진은 상업적으로 이용 가능한 Orbitrap 질량 분석기 시스템을 사용하는 방법을 사용하여 온전한 단백질의 초 복합 혼합물 및 다양한화물을 운반하는 전체 바이러스 입자에 사용할 수 있음을 보여줍니다. 이 힘과 다재다능 성은 새로운 분자 정밀도의 파동이 백 신학, 바이러스학, 신경 퇴행성 플라크 및 질병 생물학에서 일반적으로 다양한 문제를 야기 할 수있게한다. 연구를 주도한 Neil L. Kelleher는“시간이 지남에 따라 바이러스의 대량과 감염성화물을 신속하게 특성화하면 과학자들이 발생하는 돌연변이를 이해하는 데 도움이 될 수있다. "다른 바이러스 균주를 직접 특성화하거나 다른 백신 제제를 프로파일 링하든, 우리의 새로운 기술을 현재 단백질이 포함 된 샘플에 직접 배치하여 오늘날 가장 시급한 과제를 해결할 수 있습니다." Kelleher는 온전한 단백질을 연구하는 세계 최고의 그룹 중 하나와 함께 하향식 단백질체 학의 선구자입니다. 그는 Weinberg College of Arts and Sciences의 화학 및 분자 생명 과학 부서의 생명 과학 분야의 Walter and Mary Elizabeth Glass 의자입니다. 이 기술은 과학자들이 바이러스 외부의 구성 (캡시드라고 함)과 캡시드 내에 보유 된 감염성화물을 더 이해하는 데 도움이 될 것이라고 Kelleher는 말했다. 연구원은 한 번에 소수의 단일 바이러스 입자를 분석 할 수 있으므로 각 입자의 정확한 변이에 대한 정보를 추출 할 수 있습니다. 연구의 첫 저자 인 Jared O. Kafader는“많은 연구 그룹이 환자에게 생명을 구하는 약물을 전달하는 수단으로화물로 채워진 바이러스 캡시드의 사용을 연구하고있다. "우리의 기술은화물에 올바른 약물이 포함되어 있는지 확인하거나 실제로 각 바이러스 입자 내에 무엇이 있는지 알아내는 실질적인 방법을 제공합니다 ." Kafader는 노스 웨스턴의 Proteomics Center of Excellence의 선임 연구원입니다. (단백질 학은 단백질 구조 및 기능의 연구 및 분석입니다.) 최근 Journal of Proteome Research에 발표 된 Kelleher 그룹의 관련 연구는 I2MS 분석을 온전한 종의 조각화로 확장합니다. 그대로 단백질, 세분화함으로써 중요한 정보 상의 수정이나 돌연변이 위치에 대한 단백질 식별 할 수 있습니다를, 연구자들은 말했다. 이러한 변형은 암 환자에서 단백질이 어떻게 변하거나 돌연변이되는지 이해하는 데 영향을 미칩니다.

더 탐색 비 구형 바이러스 나노 케이지의 새로운 템플릿 추가 정보 : Jared O. Kafader et al., 개별 이온의 다중 질량 분석법은 proteoforms 및 그 복합체의 측정 방법을 향상시킵니다 ( Nature Methods (2020)). DOI : 10.1038 / s41592-020-0764-5 저널 정보 : Nature Methods 노스 웨스턴 대학교 제공

https://phys.org/news/2020-03-technology-probe-molecules.html

 

 

.CRISPR-HOT : 특정 유전자와 세포를 '색칠'하는 새로운 도구

CRISPR-HOT : 특정 유전자와 세포를 '색칠'하는 새로운 도구

에 의해 Hubrecht 연구소 세포의 골격을 표시하는 단백질 인 각질을 착색함으로써, 인간 간 도관 세포에서 골격 (파란색)의 미세한 구조적 세부 사항이 가시화된다. 크레딧 : Benedetta Artegiani, Delilah Hendriks, © Hubrecht Institute Hubrecht Institute의 Hans Clevers

그룹의 연구원들은 인간의 유기체 또는 소형 기관의 특정 유전자에 라벨을 붙일 수있는 새로운 유전자 도구를 개발했습니다. 그들은 CRISPR-HOT라는이 새로운 방법을 사용하여 간세포가 어떻게 분열되고 DNA가 너무 많은 비정상 세포가 어떻게 나타나는지 조사했습니다. 암 유전자 TP53을 비활성화함으로써, 비정상적인 간세포의 구조화되지 않은 분열이 더 빈번 해져 암 발생에 기여할 수 있음을 보여 주었다. 그들의 결과는 과학 저널 Nature Cell Biology 에 기술되고 출판되었다 . 오가 노이드는 실험실에서 성장할 수있는 소형 기관입니다. 이 미니 기관은 매우 작은 조직 조각에서 자라며 다양한 기관에서 가능합니다. 이러한 오가 노이드를 유전자 변형시키는 능력은 생물학적 과정을 연구하고 질병을 모델링하는 데 큰 도움이 될 것입니다. 그러나, 지금까지 유전자 변형 된 인간 오가 노이드의 생성은 쉬운 게놈 공학 방법의 부족으로 어려운 것으로 입증되었다. CRISPR-HOT 몇 년 전, 연구원들은 작은 분자 가위처럼 작용하는 CRISPR / Cas9가 DNA의 특정 위치에서 정확하게자를 수 있음을 발견했습니다. 이 새로운 기술은 유전 공학을 크게 도왔고 단순화했습니다. "DNA의 작은 상처는 세포 에서 두 가지 다른 복구 메커니즘을 활성화시킬 수 있습니다Delilah Hendriks (허브 레흐트 연구소)는 이러한 방법 중 하나는 세포가 상처 부위 대신 DNA의 새로운 부분을 차지하도록 강요 할 수 있다고 말했다. "빈번한 실수를한다고 생각하여 지금까지 새로운 DNA 조각을 삽입하는 데 자주 사용되지는 않았다"고 말했다. Benedetta Artegiani (허브 레흐트 연구소)는 이렇게 말합니다. Artegiani와 Hendriks는 비 동종 말단 결합을 통해 DNA를 인간 유기체에 삽입하는 것이 실제로 지금까지 사용 된 다른 방법보다 실제로 더 효율적이고 강력하다는 것을 발견했습니다. 그들의 새로운 방법 CRISPR-HOT. 3D 오가 노이드의 세포 분열은 건강한 (왼쪽) 오가 노이드가 조직화 된 분열 (화살표)을 나타내고, 암 유전자 TP53이 비활성화 된 오가 노이드 (오른쪽)는 혼돈 세포 분열 (화살표)을 나타낸다는 것을 보여준다. 크레딧 : Benedetta Artegiani, Delilah Hendriks, © Hubrecht Institute 채색 셀 그런 다음 연구원들은 CRISPR-HOT를 사용하여 형광 라벨을 인간 오가 노이드의 DNA에 삽입하여 형광 라벨이 특정 유전자에 부착되는 방식으로 삽입했습니다그들은 공부하고 싶었습니다. 먼저, 연구자들은 장에서 매우 드문 특정 유형의 세포 인 장 내분비 세포를 표시했습니다. 이 세포는 예를 들어 포도당 수준, 음식 섭취 및 위 비우기를 조절하는 호르몬을 생성합니다. 이 세포는 매우 드물기 때문에 연구하기가 어렵습니다. 그러나 CRISPR-HOT를 사용하여 연구원들은이 세포들을 서로 다른 색으로 쉽게 "페인트"한 후 쉽게 식별하고 분석했습니다. 둘째, 연구원들은 간에서 특정 세포 유형 인 담도 관 세포에서 유래 한 오가 노이드를 그렸습니다. CRISPR-HOT를 사용하여 세포 골격에 관여하는 단백질 인 케라틴을 시각화했습니다. 그들은이 각질을 자세하고 고해상도로 볼 수있게 되었기 때문에 연구자들은 조직을 매우 구조적으로 밝혀 냈습니다. 이들 케라틴은 또한 세포가 전문화되거나 분화 될 때 발현을 변화시킨다. 따라서 연구원들은 CRISPR-HOT가 세포 운명과 분화를 연구하는 데 유용 할 것으로 예상합니다. 

https://scx2.b-cdn.net/gfx/video/2020/crisprhotane.mp4

CRISPR-HOT를 통해 세포 분열 과정 (유사 분열 방추)의 중요한 구성 요소를 녹색으로 시각화했습니다. 먼저, 건강한 간 오가 노이드에서 세포 분열의 영화, 그런 다음 암 유전자 TP53이 비활성화 된 간 오가 노이드에서 세포 분열의 영화. 후자는 빈번한 비정상 분할을 초래했다. 크레딧 : Benedetta Artegiani, Delilah Hendriks, © Hubrecht Institute 간에서의 비정상적인 세포 분열 간에는 정상 세포의 DNA의 2 배 (또는 그 이상)를 포함하는 많은 간세포가 있습니다. 이 세포들이 어떻게 형성되는지, 그리고 비정상적인 양의 DNA로 인해 세포가 분열 될 수 있는지는 확실하지 않습니다. 고령자는 이러한 비정상적인 간세포를 더 많이 포함하고 있지만 암과 같은 질병과 관련이 있는지 확실하지 않습니다. Artegiani와 Hendriks는 CRISPR-HOT를 사용하여 간세포 에서 세포 분열 기계의 특정 성분에 라벨을 붙였습니다.오가 노이드와 세포 분열 과정을 연구했습니다. Artegiani : "우리는"정상적인 "간세포가 매우 규칙적으로 나뉘어져 항상 일정한 방향으로 두 개의 딸 세포로 나뉘어있는 것을 보았다." 헨드릭스 : "우리는 또한 비정상적인 간세포가 형성되는 여러 부분을 발견했습니다. 처음으로 우리는"정상적인 "간세포가 어떻게 비정상적인 간세포로 변하는지를 보았습니다." 이 외에도 연구원들은 간세포에서 흔히 발견되는 돌연변이가 간세포에서 비정상적인 세포 분열에 대한 유전자 TP53에서 발견되는 영향을 연구했습니다. TP53이 없으면 이러한 비정상적인 간세포가 훨씬 더 자주 나뉘어졌습니다. 이것은 TP53이 암 발병에 기여하는 방법 중 하나 일 수 있습니다. 연구원들은 CRISPR-HOT이 많은 유형의 인간 오가 노이드에 적용될 수 있으며, 모든 유전자 또는 세포 유형을 시각화하고, 많은 발달 및 질병 관련 질문을 연구 할 수 있다고 생각합니다.

더 탐색 미니 기관에서 간암 유전자의 기능 연구 추가 정보 : Artegiani, B., Hendriks, D., Beumer, J. et al. 상동성에 독립적 인 CRISPR–Cas9 정밀 게놈 편집을 사용하여 빠르고 효율적인 인간 오가 노이드 생성. Nat Cell Biol (2020). doi.org/10.1038/s41556-020-0472-5 저널 정보 : Nature Cell Biology Hubrecht Institute 제공

https://phys.org/news/2020-03-crispr-hot-tool-specific-genes-cells.html





.음, 꼬리가 보인다



A&B, study(laboratory evolution, mainhotspot project)

B/http://www.mdpi.com/2072-4292/10/8/1261
A/https://www.nature.com/articles/s41598-018-28963-0
https://pr.ibs.re.kr/handle/8788114/5556?mode=full
https://www.nature.com/articles/s41598-018-28963-0
Park Soo-jin is a meteorologist. She is Lee Hyun Kyu's friend of the same age.

 

 

.Scanning Doppler Lidar를 이용한 행성 경계층 바람의 측정

박수진 1, 제1저자 연구원

 

박수진 1, 김상우 1 세 *OrcID, 박문수 2OrcID과 송창근 3 1 서울 대학교 지구 환경 과학부 08826 2 한국 외국어 대학교 대기 과학 연구소, 용인 17035 삼 울산 국립 기술 대학교 도시 환경 공학부 울산 44919 * 서신을 처리해야하는 작성자. 접수 : 2018 년 6 월 19 일 / 개정 : 2018 년 8 월 7 일 / 수락 : 2018 년 8 월 8 일 / 게시일 : 2018 년 8 월 10 일 (이 기사는 대기 경계층 특집 원격 감지 (Remote Sensing of Atmospheric Boundary Layer )에 속한다. 전체 텍스트 | PDF [4697 KB, 2018 년 8 월 11 일 업로드 됨] | 피규어

추상

유성 경계층 (PBL)에서 바람 프로파일의 정확한 측정은 수치 기상 예측뿐만 아니라 대기 품질 모델링에서도 중요합니다. 스캐닝 도플러 광 검출 및 거리 측정 (라이더) 측정을 사용하는 두 가지 바람 검색 방법을 비교하고 동시 라디오 존데 음향으로 검증했습니다. 17 개의 라디오 존데 (radiosonde) 사운드 프로파일을 비교해 보면 사인 피팅 방법이 더 많은 수의 데이터 포인트를 검색 할 수 있다는 것을 보여 주었지만 특이 값 분해 방법은 바이어스 (0.57 ms -1 )와 평균 제곱근 오차 (1.75 ms -1)와 라디오 존데 soundings. 속도 방위각 디스플레이 스캔을 얻기 위해 방사 속도의 평균 시간 간격을 15 분으로 늘리면 소음에 대한 평균 신호 효과로 인해 라디오 존데 소리와 더 잘 일치하게됩니다. 나란히 놓인 윈드 도플러 라이더와 에어러솔 미사 산란 라이저에서 동시에 측정 한 결과 PBL 바람의 시간적 변화와 PBL 내 에어러솔의 수직 분포가 나타났다.

https://www.mdpi.com/2072-4292/10/8/1261

참고.

https://scitechdaily.com/harvard-scientist-connects-the-dots-in-fin-to-limb-evolution/

https://phys.org/news/2019-09-black-hole-center-galaxy-hungrier.html

https://phys.org/news/2019-09-programmable-swarmbots-flexible-biological-tools.html

https://phys.org/news/2019-10-hard-ceramic-tough-steel-newly.html

http://www.sci-news.com/astronomy/earth-sized-exoplanet-habitable-zone-red-dwarf-toi-700d-07991.html

또 다른 모델은 TOI-700d를 구름이없는 전 지구의 현대 지구 버전으로 묘사합니다. 별빛이 행성의 대기를 통과 할 때 이산화탄소와 질소와 같은 분자와 상호 작용하여 스펙트럼 선 (spectral line)이라고하는 독특한 신호를 생성합니다.”또한 과학자들은 TOI-700d의 20 가지 모델 게시되었습니다 .

https://scitechdaily.com/astronaut-says-alien-lifeforms-that-are-impossible-to-spot-may-be-living-among-us/

버전에 대해 시뮬레이션 된 스펙트럼을 생성했습니다.

 

 

.레이저 미니 자석의 도움으로 급상승하는 클라우드 데이터 속도

에 의해 에딘버러 대학 단일 분자 자석 모델 크레딧 : Dr Olof Johansson 2020 년 3 월 2 일

초소형 레이저 활성화 자석을 사용하면 클라우드 컴퓨팅 시스템이 현재 기술보다 최대 100 배 빠르게 데이터를 처리 할 수 ​​있다고 연구 결과는 밝혔습니다. 화학자들은 클라우드 기반 서버에 사용되는 하드 드라이브 의 저장 용량 과 처리 속도를 높일 수있는 새로운 자성 물질을 연구했습니다 . 이를 통해 클라우드 데이터 시스템을 사용하는 사람들이 몇 분이 아닌 몇 초 만에 큰 파일을로드 할 수 있다고 연구원들은 말합니다. 에든버러 대학 (University of Edinburgh)의 과학자들이 이끄는 팀은 실험실에서 단일 분자 자석으로 알려진 물질을 만들었습니다. 그들은 화합물에 자기 특성 을 부여 하는 화학 결합 이 레이저의 빠른 펄스를 비추어 제어 할 수 있음을 발견했습니다. 이 화합물은 주로 원소 망간으로 구성되며, 자석을 의미하는 라틴어 마그네 (magnes)의 이름을 따서 명명됩니다. 연구 결과에 따르면 1 백만 분의 1 초에 이르는 레이저 펄스를 사용하여 자석에 데이터를 저장하고 액세스 할 수 있다고합니다. 이를 통해 자석이 장착 된 하드 드라이브가 현재 기술보다 최대 100 배 더 빠르게 데이터를 처리 할 수 ​​있습니다. 이 개발은 또한 클라우드 컴퓨팅 시스템의 에너지 효율을 향상시킬 수 있다고 팀은 말했다. 기존 하드 드라이브 는 전선을 통해 전류를 통과시켜 생성 된 자기장을 사용하여 데이터를 저장 하므로 많은 열이 발생한다고 연구원들은 말했다. 이것을 레이저 활성화 메커니즘으로 대체하면 열을 생성하지 않으므로 에너지 효율이 높아집니다. Nature Chemistry 저널에 발표 된이 연구에는 Newcastle University의 연구원들도 참여했습니다. 에딘버러 왕립 학회, 카네기 트러스트 및 공학 및 물리 과학 연구위원회가 자금을 지원했습니다. 이 연구를 주도한 에든버러 대학교 화학 대학 올로프 요한슨 박사는 다음과 같이 말했습니다 : 클라우드 기반 스토리지 서버에 사용되는 드라이브는 작동하고 시원하게 유지하기 위해 엄청난 양의 전력이 필요합니다.이 작업은 과학자들이 차세대 데이터 스토리지 장치를 개발하는 데 도움이 될 수 있습니다. "

더 탐색 과학자들이 광 펄스를 사용하여 개발 한 에너지없는 초고속 컴퓨팅 추가 정보 : Florian Liedy et al. 초고속 광 여기 후 망간 단일 분자 자석의 진동 일관성, Nature Chemistry (2020). DOI : 10.1038 / s41557-020-0431-6 저널 정보 : Nature Chemistry 에든버러 대학교 제공

https://phys.org/news/2020-03-cloud-soar-aid-laser-mini-magnets.html

 

 

.3 차원 종양 클러스터를 구축하는 노화 종양 세포

 

논문저자 이현규1, 논문저자 고려대 이현규 Hyun-Gyu Lee1,

June Hoan Kim 2, Woong Sun 2, Sung-Gil Chi3, WonshikChoi 1,4 & Kyoung J. Lee1 ,Scientific Reports volume 8 , 문서 번호 : 10503 ( 2018 ) | 인용문 다운로드 추상 세포 노화 (영구적 인 세포주기 정지)는 생물학적 유기체에 대한 유익한 중요성이 아직 탐구되기 시작한 공통적 인 흥미로운 현상입니다. 다른 한편으로는, 노화 세포는 그들 주위의 조직 구조를 변형시킬 수있다. 무한히 증식 할 수있는 능력을 가진 종양 세포는 그 현상으로부터 자유롭지 못합니다. 여기에 우리는 유방암 식민지의 고밀도 단일 층에있는 노화 세포가 주변에있는 비 노화 세포의 집합 센터 역할을하는 놀라운 관찰을보고합니다. 결과적으로, 노화 세포는 융합 성인 2D 종양 층에서 국소화 된 3D 세포 - 클러스터를 활발히 형성한다. 놀라운 현상을 뒷받침하는 생물 리 학적 메커니즘은 주로 유사 분열 세포 반올림, 동적 및 차동 세포 부착 및 세포 주 화성을 포함한다. 이러한 몇 가지 생물 물리학 적 요소를 통합함으로써 우리는 세포 Potts 모델을 통해 실험 관측을 재현 할 수있었습니다.

 

소개

세포 노화는 증식하는 세포가 완전한 성장 억제에 들어가고 그 체적을 극적으로 팽창시키는 (일반적으로, 2 차원 기질에서 튀긴 알 의 형태로) 생물체에서 공통적 인 현상이다 . 이 세포 상태의 근원은 강하게 연구되어왔다. 그러나 그 기본 메커니즘은 명확하지 않다. 1 , 2. 중요하게 노화 세포는 노화 관련 분비 표현형 (SASPs)으로 총체적으로 분류되는 다수의 분비물을 통해 그 이웃과 상호 작용한다. 이러한 분비 표현형은 생물에 부정적인 영향을 미치는 다양한 생물학적 과정에 관여하는 것으로 알려져있다. 예를 들어, 주위의 악성 종양 세포의 성장을 자극하는 친 염증성 사이토 카인과 케모카인이 그 중 3 개 , 4 개 입니다. 노화 세포의 축적은 또한 나이 - 관련 질환과 같은 더 많은 유기체 레벨 부작용과 연관된 5. 특히 조직 개조를 촉진 할 수도 있습니다. 예를 들어, 일부 세포 노화 따라서 암세포의 침윤 촉진 소프 주변 조직 구조를 만드는 세포 외 매트릭스 저하 프로테아제를 분비 6 , 7 , 8 . 한편, 노화 세포에 대한 유익한 효과에 대해서도 최근 논의된다. SASP는 배아 패터닝 9 , 10 및 상처 치료 11에 기여하는 단백질을 포함 합니다. 그럼에도 불구하고 이러한 조직 재생 효과가 SASP에 의해 생물 물리학 적으로 조율되는 방법의 정확한 성격은 특히 조직에 대한 개별 세포의 규모에서 많이 연구되어야합니다. 이 논문에서는 단일 클론 세포주 인 MDA-MB-231 (널리 사용되는 악성 유방암 세포주)의 시험 관내 배양을 바탕으로 초기 시딩 및 이웃 노화 방지와의 상호 작용에서 신생 세포의 출현을 신중하게 분석합니다 세포. 놀랍게도, 불멸화 된 종양 세포조차도 노화를 일으키는 것으로 나타났습니다 12 . 더 흥미 진진한 것은 노화 된 MDA-MB-231 세포가 인접한 종양 세포에 대한 인력의 중심 역할을하여 처음에 2 층 (2D) 콜로니의 단층에서 3 차원 (3D ) 세포 클러스터. 우리는 전환 이 시험 관내 에서 명확한 것으로 나타남을 본다.예를 들어 노화 세포가 조직 개질에 관여 할 수있는 사례. 또한 몇 가지 필수 메커니즘만으로 통합 된 컴퓨터 모델을 통한 관찰에 대한 경험적 설명을 제공합니다. Metropolis kinetics에서 작동하는 셀룰러 Potts 모델 (CPM)은 세포 부피의 보존, 유사 분열 세포 반올림 (결과적으로 세포 - 환경 유착의 동적 강도)과 같은 생물 물리학 적 과정을 재현하는 것을 목표로하며, 세포의 주 화성 운동. 실험 결과 MDA-MB-231 세포 배양 물 (처음에는 직경 2mm의 디스크 영역에 균일하게 도금 된 합류 단일 층 (confluent mono layer),도 1a 참조, 방법에 대한 자세한 내용 참조)은 다수의 노화 세포가 전체 집단으로 무작위로 출현한다 시간이 지남에 따라 증가한다 (그림 1b ). 그들은 '튀긴 계란'형태로 쉽게 식별 할 수 있습니다 (그림 1c ). 노화 된 상태로 들어가는 세포의 몸체는 꽤 합류하는 인구 내에서도 거대한 지역을 차지하기 위해 며칠 동안 측면으로 팽창합니다 (그림 1c ). 완전히 개발 노화 세포의 점유 면적이 현저하게 다른 하나에서 다를 수 있지만, 일반적으로 1.4 × 10 종종 크고 매우 큰 수 5  μ m (2) (도. 참조 1D를) - 전형적인 비 노화 세포보다 약 3 배 더 크다. 반면에 노화 세포의 몸은 ~ 2 μ m 만큼 얇  습니다 (그림 1e 의 두 측면보기 참조 ). 신체는 f-actin의 조밀 한 네트워크에 의해 구조적으로 잘 유지됩니다 (그림 1e 의 상단 그림 참조 ). 세포가 갑자기 파열되어 대사 과정을 끝낼 때까지 끊임없는 시공간 파동이 몸 전체에 나타나며 핵쪽으로 향하게됩니다.

https://www.nature.com/articles/s41598-018-28963-0

https://www.nature.com/articles/s41598-018-28963-0.pdf

 

 

.과학자들은 또한 붉은 행성(mars)에서 화석화 된 미생물 생명의 징후를 찾는 데 도움이 될 수 있습니다

 

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