.Scientists Have Discovered a Cancer “Fingerprint,” Revolutionizing Early Detection
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.Scientists Have Discovered a Cancer “Fingerprint,” Revolutionizing Early Detection
과학자들이 암 "지문"을 발견해 조기 발견에 혁명을 일으켰습니다
Center for Genomic Regulation 에서 제공2024년 12월 20일
에피트랜스크립토믹 지문 '후성전사체' 지문의 예술적 개념. 출처: Queralt Tolosa/Centro de Regulación Genómica 몇 시간 안에 소형 휴대용 스캐너를 사용하면 거의 완벽한 정밀도로 변화를 파악할 수 있습니다. 다양한 유형의 암은 질병의 초기 단계에서 놀라운 정확도 로 식별할 수 있는 독특한 분자 "지문"을 가지고 있습니다. 오늘 Molecular Cell 에 발표된 연구에 따르면, 작고 휴대하기 편리한 스캐너는 단 몇 시간 만에 이러한 지문을 감지할 수 있습니다 .
바르셀로나에 있는 유전체 조절 센터(CRG)의 연구자들은 이러한 획기적인 진전을 이루어내, 현재 방법보다 더 빨리, 더 초기 단계에서 다양한 유형의 암을 식별할 수 있는 비침습적 진단 검사의 길을 열었습니다. 이 연구는 세포의 단백질 공장인 리보솜을 중심으로 진행됩니다.
수십 년 동안 리보솜은 인체 전체에서 동일한 청사진을 가지고 있다고 여겨졌습니다. 그러나 연구자들은 다양한 조직, 발달 단계 및 질병에 따라 달라지는 미세한 화학적 변형이라는 숨겨진 복잡성 층을 발견했습니다. "우리의 리보솜은 모두 똑같지 않습니다. 리보솜은 다른 조직에 특화되어 있으며 우리 몸 내부에서 일어나는 일을 반영하는 고유한 특징을 가지고 있습니다."
연구의 주저자이자 CRG의 연구원인 ICREA 연구 교수 에바 노보아가 말했습니다. "이러한 미묘한 차이점은 건강과 질병에 대해 많은 것을 알려줄 수 있습니다." 리보솜은 단백질과 리보솜 RNA(rRNA)라는 특수한 유형의 RNA 분자로 구성되어 있습니다. rRNA 분자는 화학적 변형의 표적이 되어 리보솜의 기능에 영향을 미칩니다. "인간 RNA의 95%는 리보솜 RNA입니다. 리보솜 RNA는 우리 세포에 매우 흔합니다."라고 Novoa 박사는 덧붙였습니다.
조직 특정 지문 식별 연구자들은 뇌, 심장, 간, 고환을 포함한 여러 다른 조직에서 인간과 생쥐 rRNA의 모든 유형의 화학적 변형을 찾았습니다. 그들은 각 조직이 고유한 rRNA 변형 패턴을 가지고 있음을 발견했습니다. 그들은 이를 '전사체 지문'이라고 부릅니다. "리보솜의 지문은 세포가 어디에서 왔는지 알려줍니다." 연구의 첫 번째 저자인 이반 밀렌코비치 박사의 말입니다. "각 조직이 잃어버린 것과 찾은 것에 대한 세포가 발견될 경우를 대비해 태그에 주소를 남기는 것과 같습니다."
연구팀은 암 환자의 병든 조직 샘플에서, 특히 폐와 고환에서 서로 다른 지문 세트를 발견했습니다. "암 세포는 '저변형'되어 있습니다. 즉, 이러한 화학적 표식 중 일부를 끊임없이 잃는다는 뜻입니다." 밀렌코비치 박사가 말했습니다. "우리는 이것이 강력한 바이오마커가 될 수 있다고 생각했습니다." 그는 덧붙였습니다. 이 연구는 폐암을 더 자세히 살펴보았습니다. 연구원들은 1기 또는 2기 폐암 환자 20명으로부터 정상 및 병든 조직을 얻었고 암세포의 rRNA가 저변형되었음을 확인했습니다. 그들은 이 데이터를 사용하여 이 독특한 분자 지문의 데이터만을 기반으로 샘플을 분류할 수 있는 알고리즘을 훈련했습니다. 이 검사는 폐암과 건강한 조직을 구별하는 데 거의 완벽한 정확도를 달성했습니다. "대부분의 폐암은 발달의 후기 단계까지 진단되지 않습니다. 여기서 우리는 평소보다 훨씬 일찍 폐암을 발견할 수 있었고, 언젠가는 환자에게 귀중한 시간을 벌어줄 수 있을 것입니다."라고 밀렌코비치 박사는 말합니다. 나노포어 시퀀싱 기술의 혁신 이 연구는 나노포어 직접 RNA 시퀀싱이라는 새로운 기술 덕분에 가능했는데, 이 기술을 사용하면 모든 수정 사항이 포함된 rRNA 분자를 직접 분석할 수 있습니다. Novoa 박사는 "이 기술을 사용하면 수정 사항을 자연스러운 맥락에서 있는 그대로 볼 수 있습니다."라고 말합니다.
나노포어 시퀀싱이 등장하기 전에는 기존 기술을 사용하여 연구자들이 연구하기 전에 화학적 변형을 제거하는 방식으로 RNA 분자를 처리했습니다. "과학자들은 리보솜 RNA를 일반적으로 제거했습니다. 리보솜 RNA를 실험에 방해가 되는 중복 정보로 여겼기 때문입니다. 몇 년이 빠르게 흐르면서 우리는 이 데이터를 폐차장에서 꺼내 금광으로 바꾸었습니다. 특히 화학적 변형에 대한 정보가 수집되었을 때 더욱 그렇습니다. 놀라운 반전입니다."라고 Novoa 박사는 말합니다.
나노포어 시퀀싱의 장점은 손바닥에 들어갈 수 있는 작고 휴대하기 편한 시퀀싱 장치에 의존한다는 것입니다. 연구자들은 생물학적 샘플을 기계에 삽입할 수 있으며, 기계는 실시간으로 RNA 분자를 포착하고 스캔합니다. 이 연구는 조직 샘플에서 얻은 RNA 분자 250개만 스캔하여 암세포와 정상세포를 구별할 수 있었습니다. 이는 일반적인 나노포어 시퀀싱 장비가 할 수 있는 것의 일부에 불과합니다. Novoa 박사는 "최소한의 조직을 사용하여 암의 리보솜 지문을 찾는 빠르고 정확도가 높은 검사를 개발하는 것이 가능합니다."라고 말합니다.
비침습적 진단을 향해 장기적으로 연구자들은 혈액 내 순환 RNA에서 암의 지문을 검출할 수 있는 진단 방법을 만들고 싶어합니다. 이는 환자의 조직 샘플을 채취하는 대신 혈액 샘플만 필요하기 때문에 덜 침습적인 접근 방식이 될 것입니다. 연구 저자들은 이 접근법이 임상적 이점을 위해 사용되기 전에 더 많은 연구가 필요하다고 경고합니다. 밀렌코비치 박사는 "우리는 아직 피상적인 단계에 불과합니다."라고 말합니다. "다양한 인구와 암 유형에 걸쳐 이러한 바이오마커를 검증하기 위해 더 큰 규모의 연구가 필요합니다."
아직 탐구해야 할 큰 의문 중 하나는 왜 암에서 이러한 변형이 변하는가 하는 것입니다. rRNA 변형이 세포가 통제되지 않는 성장과 생존을 촉진하는 단백질을 생성하는 데 도움이 된다면, 연구자들은 변형을 추가하거나 제거하는 데 책임이 있는 메커니즘을 식별하여 잠재적으로 해로운 변화를 역전시키는 새로운 방법을 찾아낼 수 있습니다. "우리는 천천히 그러나 확실히 이 복잡성을 풀어내고 있습니다." 노보아 박사가 말했습니다. "세포의 언어를 이해하기 시작하기까지는 시간 문제일 뿐입니다." 그녀는 결론을 내렸습니다.
참고 자료: Ivan Milenkovic, Sonia Cruciani, Laia Llovera, Morghan C. Lucas, Rebeca Medina, Cornelius Pauli, Daniel Heid, Thomas Muley, Marc A. Schneider, Laura V. Klotz, Michael Allgäuer, Ruben Lattuca, Denis LJ Lafontaine, Carsten Müller-Tidow 및 Eva Maria Novoa, 2024년 12월 10일, Molecular Cell . DOI: 10.1016/j.molcel.2024.11.014
B메모 2412210203 소스1.요약 분석중_【】
1.
과학자들이 암 "지문"을 발견해 조기 발견에 혁명을 일으켰다.
몇 시간 안에 소형 휴대용 스캐너를 사용하면 거의 완벽한 정밀도로 변화를 파악할 수 있다. 다양한 유형의 암은 질병의 초기 단계에서 놀라운 정확도로 식별할 수 있는 독특한 분자 "지문"을 가지고 있다. 오늘 Molecular Cell 에 발표된 연구에 따르면, 작고 휴대하기 편리한 스캐너는 단 몇 시간 만에 이러한 지문을 감지할 수 있다 .
바르셀로나에 있는 유전체 조절 센터(CRG)의 연구자들은 이러한 획기적인 진전을 이루어내, 현재 방법보다 더 빨리, 더 초기 단계에서 다양한 유형의 암을 식별할 수 있는 비침습적 진단 검사의 길을 열었다.
1-1.
이 연구는 세포의 단백질 공장인 리보솜을 중심으로 진행된다. 수십 년 동안 리보솜은 인체 전체에서 동일한 청사진을 가지고 있다고 여겨졌다. 그러나 연구자들은 다양한 조직, 발달 단계 및 질병에 따라 달라지는 미세한 화학적 변형이라는 숨겨진 복잡성 층을 발견했다.
우리의 리보솜은 모두 똑같지 않다. 리보솜은 다른 조직에 특화되어 있으며 우리 몸 내부에서 일어나는 일을 반영하는 고유한 특징을 가지고 있다. 이러한 미묘한 차이점은 건강과 질병에 대해 많은 것을 알려줄 수 있다.
1-2.
리보솜은 단백질과 리보솜 RNA(rRNA)라는 특수한 유형의 RNA 분자로 구성되어 있다. rRNA 분자는 화학적 변형의 표적이 되어 리보솜의 기능에 영향을 미친다. [1-2]인간 RNA의 95%는 리보솜 RNA]이다. 리보솜 RNA는 우리 세포에 매우 흔하다.
_[1-2】문뜩, msbase와 연관 되지 않는 제3의 독자적인 모습의 qpeoms가 존재하는 게 아닌가?() 0247시각, 방금 정의역이 나타났다. 혹시 oss급??() 대박칠 일이여. 세포를 msbase로 가정하고 qpeoms가 분해자인 것은 맞는데..ms 분해자 역할이 아닌 형태로 독자적인 존재성을 가진 oss급?? msbase와는 그저 오가며 만난 것이고 필연이 아니면 암흑물질이 보통물질과 연관 없이도 존재하는 것일 수 있고, 우주도 인류의 지적기준인 표준모형에 따른 빅뱅설에 연연하지 않을 것이다. 어허.
msbase.msoss.qpeoms이 msbase-msoss-qpeoms로 3축 a-b-c 개별적 영역이라면 삼각함수? 3원소? 3차원? 이들이 나의 새로운 해석과학을 만들어 가고 있는듯...() 이는 매우 중요한 발견이다. 1시간 전, 까지에도 이런 생각을 한적이 없다. 허허.
1-3.조직 특정 지문 식별
연구자들은 뇌, 심장, 간, 고환을 포함한 여러 다른 조직에서 인간과 생쥐 rRNA의 모든 유형의 화학적 변형을 찾았다. 그들은 각 조직이 고유한 rRNA 변형 패턴을 가지고 있음을 발견했다. 그들은 이를 '전사체 지문'이라고 부른다.
리보솜의 지문은 세포가 어디에서 왔는지 알려준다. 각 조직이 잃어버린 것과 찾은 것에 대한 세포가 발견될 경우를 대비해 태그에 주소를 남기는 것과 같다.
연구팀은 암 환자의 병든 조직 샘플에서, 특히 폐와 고환에서 서로 다른 지문 세트를 발견했다. 암 세포는 '저변형'되어 있다. 즉, 이러한 화학적 표식 중 일부를 끊임없이 잃는다는 뜻이다. 이것이 강력한 바이오마커가 될 수 있다고 그들은 생각했다.
1-4.
이 연구는 폐암을 더 자세히 살펴보았다. 연구원들은 1기 또는 2기 폐암 환자 20명으로부터 정상 및 병든 조직을 얻었고 암세포의 rRNA가 저변형되었음을 확인했다. 그들은 이 데이터를 사용하여 이 독특한 분자 지문의 데이터만을 기반으로 샘플을 분류할 수 있는 알고리즘을 훈련했다.
이 검사는 폐암과 건강한 조직을 구별하는 데 거의 완벽한 정확도를 달성했다. "대부분의 폐암은 발달의 후기 단계까지 진단되지 않았다. 여기서 우리는 평소보다 훨씬 일찍 폐암을 발견할 수 있었고, 언젠가는 환자에게 귀중한 시간을 벌어줄 수 있을 것이다.
2.
나노포어 시퀀싱 기술의 혁신
이 연구는 나노포어 직접 RNA 시퀀싱이라는 새로운 기술 덕분에 가능했는데, 이 기술을 사용하면 모든 수정 사항이 포함된 rRNA 분자를 직접 분석할 수 있다. 이 기술을 사용하면 수정 사항을 자연스러운 맥락에서 있는 그대로 볼 수 있다.
나노포어 시퀀싱이 등장하기 전에는 기존 기술을 사용하여 연구자들이 연구하기 전에 화학적 변형을 제거하는 방식으로 RNA 분자를 처리했다
[2]리보솜 RNA를 일반적으로 제거했다. 리보솜 RNA를 실험에 방해가 되는 중복 정보로 여겼기 때문]이다. 몇 년이 빠르게 흐르면서 [2']이 데이터를 폐차장에서 꺼내 금광으로 바꾸었다]. 특히 화학적 변형에 대한 정보가 수집되었을 때 더욱 그렇다. 놀라운 반전이다.
_[2'】멍청하기는 ..먼저 광부들은 파도파도 안나오는 금덩이가 나중 광부의 놀라운 리보솜RNA 직감으로 폐광산에서 1m를 더 다시 파보니, 금광이 나타났다? 이는 msbase가 퍼즐이 과학이 되는 qpeoms의 순간과 유사하다. 숫자더미. 질량더미가 소립자 단위수준으로 분해되는 것을 나는 매일매일 목격한다. 광자나 중성미자도 msbase에 불과하다면 더 작게 qpeoms 효소분해된다. 하물며 암세포의 dna가 rRNA로 분해되는 과정 쯤이야 그렇게 어려운 문제가 아닐 수 있다. 해답은 분해하는 매카니즘을 qpeoms에 둬야 암정복 정답의 결론이 나온다. 어허.
3.
나노포어 시퀀싱의 장점은 손바닥에 들어갈 수 있는 작고 휴대하기 편한 시퀀싱 장치에 의존한다는 것이다. 연구자들은 생물학적 샘플을 기계에 삽입할 수 있으며, 기계는 실시간으로 RNA 분자를 포착하고 스캔한다.
이 연구는 조직 샘플에서 얻은 RNA 분자 250개만 스캔하여 암세포와 정상세포를 구별할 수 있었다. 이는 일반적인 나노포어 시퀀싱 장비가 할 수 있는 것의 일부에 불과하다. 최소한의 조직을 사용하여 [3]암의 리보솜 지문]을 찾는 빠르고 정확도가 높은 검사를 개발하는 것이 가능하다.
_[3】암의 리보섬 지문? 그게 세포의 dna를 rRnNA.qpeoms 분해하여 재조합되는 그 모든 가능성에 매카니즘에 답이 있다. 으음.
4.비침습적 진단을 향해
장기적으로 연구자들은 [4]혈액 내 순환 RNA에서 암의 지문을 검출할 수 있는 진단 방법]을 만들고 싶어한다. 이는 환자의 조직 샘플을 채취하는 대신 혈액 샘플만 필요하기 때문에 덜 침습적인 접근 방식이 될 것이다.
연구 저자들은 이 접근법이 임상적 이점을 위해 사용되기 전에 더 많은 연구가 필요하다고 경고한다. 그러나 아직 피상적인 단계에 불과하다. 다양한 인구와 암 유형에 걸쳐 이러한 바이오마커를 검증하기 위해 더 큰 규모의 연구가 필요하다.
_[4】암의 지문은 _[5】에 답이 있을 수 있다. 분석을 꺼구로 하는 감이 있는데, 소스1. 분석에 있어 순서는 그다지 중요하지 않다.
5.
아직 탐구해야 할 큰 의문 중 하나는 왜 암에서 이러한 변형이 변하는가 하는 것이다. [5]rRNA 변형이 세포가 통제되지 않는 성장과 생존을 촉진하는 단백질을 생성]하는 데 도움이 된다면,
_[5】rRNA는 msbase을 빵처럼 이스트 효소로 부풀게 하여 분해하는 모습과 같다면 그 효소 역할은 qpeoms.unit이 한다. 세포의 DNA도 부플리면 rRNA.qpeoms의 사슬이 나타나고 이들이 sms.oms.vix.ain의 키랄 선형나선 이중 삼중. 다중구조로 새로운 조합이 다시 뭔 DNA를 만들어 성장과 생존을 촉진하는 단백질을 만든다면 암세포가 어떻게 발생하는지 그림이 보일 수 있다. 어허.
이 과정에서 암의 지문이 감지된다.
5-1.
연구자들은 변형을 추가하거나 제거하는 데 책임이 있는 메커니즘을 식별하여 잠재적으로 해로운 변화를 역전시키는 새로운 방법을 찾아낼 수 있다.
천천히 그러나 확실히 이 복잡성을 풀어내고 있다. 세포의 언어를 이해하기 시작하기까지는 시간 문제일 뿐으로 결론 내렸다.
B Memo 2412210203 Source 1. Summary Analysis_【】
1.
Scientists have discovered a cancer “fingerprint” that could revolutionize early detection.
Within hours, a small, portable scanner can identify changes with near-perfect precision. Different types of cancer have unique molecular “fingerprints” that can be identified with incredible accuracy in the early stages of the disease. According to a study published today in Molecular Cell, a small, portable scanner can detect these fingerprints in just a few hours.
Researchers at the Centre for Genomic Regulation (CRG) in Barcelona have made this breakthrough, paving the way for a noninvasive diagnostic test that could identify different types of cancer faster and at earlier stages than current methods.
1-1.
The study centers on the ribosome, the protein factory of the cell. For decades, ribosomes were thought to have the same blueprint throughout the body. But researchers have discovered a hidden layer of complexity: subtle chemical modifications that vary across different tissues, stages of development, and diseases.
Our ribosomes are not all the same. They are specialized for different tissues and have unique characteristics that reflect what is going on inside our bodies. These subtle differences can tell us a lot about health and disease.
1-2.
Ribosomes are made up of proteins and a special type of RNA molecule called ribosomal RNA (rRNA). The rRNA molecule is the target of chemical modifications that affect the function of the ribosome. [1-2]95% of human RNA is ribosomal RNA]. Ribosomal RNA is very common in our cells.
_[1-2] Suddenly, I wondered, isn't there a third, independent form of qpeoms that is not related to msbase?() At 0247, the domain just appeared. Is it oss-class??() This is a big deal. Assuming cells are msbases, qpeoms are decomposers, but... is there an independent existence of oss-class that is not a decomposer? msbase and I just met each other and if it is not inevitable, dark matter may exist without being related to ordinary matter, and the universe will not be obsessed with the Big Bang theory according to the standard model, which is the intellectual standard of mankind. Oh my.
If msbase.msoss.qpeoms is msbase-msoss-qpeoms, then trigonometric functions? 3 elements? 3 dimensions? It seems like they are creating my new interpretation science...() This is a very important discovery. I never thought of this until an hour ago. Hehe.
1-3. Tissue-specific fingerprint identification
The researchers looked for all types of chemical modifications of human and mouse rRNA in several different tissues, including the brain, heart, liver, and testis. They found that each tissue had a unique pattern of rRNA modifications. They called this a 'transcriptome fingerprint'.
The ribosome fingerprint tells us where the cell came from. It’s like leaving an address on a tag for the cells to find out what each tissue has lost and what it has found.
The team found a different set of fingerprints in samples of diseased tissue from cancer patients, particularly in the lungs and testes. The cancer cells were “hypomutated,” meaning they were constantly losing some of these chemical markers. They thought this could be a powerful biomarker.
1-4.
The study looked more closely at lung cancer. The researchers obtained normal and diseased tissue from 20 patients with stage 1 or 2 lung cancer and found that the rRNA in the cancer cells was hypomutated. They used this data to train an algorithm that could classify samples based solely on data from this unique molecular fingerprint.
The test achieved near-perfect accuracy in distinguishing lung cancer from healthy tissue. "Most lung cancers are not diagnosed until the later stages of development. Here, we can detect lung cancer much earlier than usual, which could one day buy patients precious time.
2.
A breakthrough in nanopore sequencing technology
This study was made possible by a new technology called nanopore direct RNA sequencing, which allows researchers to directly analyze rRNA molecules with all their modifications. This allows them to see the modifications in their natural context.
Before the advent of nanopore sequencing, researchers used existing techniques to process RNA molecules by removing chemical modifications before studying them.
[2]Ribosomal RNA was generally removed, because it was considered redundant information that interfered with experiments. Fast forward a few years, [2']and this data was taken out of the junkyard and turned into a gold mine. Especially when information about chemical modifications was collected. It was a surprising twist.
_[2']Stupid..First, the miners found a gold nugget that was not even worth the effort, but later, the miners found a surprising Ribosomal RNA Intuition Digging 1m further into the abandoned mine, a gold mine appeared? This is similar to the moment when msbase becomes a puzzle and science in qpeoms. A pile of numbers. I witness every day that a pile of mass is broken down into subatomic particles. If photons or neutrinos are only msbases, they are broken down even smaller by qpeoms enzymes. Furthermore, the process of cancer cell DNA being broken down into rRNA may not be such a difficult problem. The answer is that the mechanism of breaking down must be placed in qpeoms to conclude the correct answer to conquering cancer. Oh.
3.
The advantage of nanopore sequencing is that it relies on a small, portable sequencing device that can fit in the palm of your hand. Researchers can insert biological samples into the machine, and the machine captures and scans RNA molecules in real time.
This study was able to distinguish cancer cells from normal cells by scanning only 250 RNA molecules obtained from tissue samples. This is more than a typical nanopore sequencing device can do. It’s only a small part of what’s out there. It’s possible to develop a fast, highly accurate test that uses minimal tissue to find [3] cancer ribosomal fingerprints.
_[3] cancer ribosomal fingerprints? That’s the mechanism by which the cell’s DNA is broken down into rRnNA.qpeoms and reassembled. Hmm.
4. Towards noninvasive diagnostics
In the long term, researchers hope to create a diagnostic method that can detect cancer fingerprints in circulating RNA in the blood. This would be a less invasive approach, since it would require only a blood sample instead of a patient’s tissue sample.
The study authors caution that more research is needed before this approach can be used for clinical benefit. However, this is only a cursory step. Larger studies are needed to validate these biomarkers across different populations and cancer types.
_[4] cancer fingerprints may be the answer to _[5]. It feels like the analysis is being turned off, but the order of the analysis is not that important.
5.
One of the big questions that remains to be explored is why these mutations change in cancer. [5] If rRNA mutations help cells produce proteins that promote uncontrolled growth and survival,
_[5] If rRNA is like yeast enzymes that break down msbases by puffing them up like bread, then qpeoms.unit is the enzyme that does the job. If the DNA of a cell also puffs up, and chains of rRNA.qpeoms appear, and these combine into new structures of chiral linear helix double triplet multi-structures of sms.oms.vix.ain to make DNA that then makes proteins that promote growth and survival, then we can see how cancer cells develop. Oh, my.
This process detects the fingerprint of cancer.
5-1.
By identifying the mechanisms responsible for adding or removing mutations, researchers can find new ways to reverse potentially harmful changes.
Slowly but surely, we are unraveling this complexity. It is only a matter of time before we begin to understand the language of cells, they conclude.
ㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡ
Source 1.
https://scitechdaily.com/scientists-have-discovered-a-cancer-fingerprint-revolutionizing-early-detection/
Scientists have discovered a cancer "fingerprint" that is revolutionizing early detection.
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